Protein–RNA interactions for Protein: Q9R269

Ppl, Periplakin, mousemouse

Predictions only

Length 1,755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PplQ9R269 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PplQ9R269 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PplQ9R269 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PplQ9R269 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PplQ9R269 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PplQ9R269 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PplQ9R269 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PplQ9R269 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PplQ9R269 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PplQ9R269 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PplQ9R269 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PplQ9R269 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PplQ9R269 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PplQ9R269 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PplQ9R269 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PplQ9R269 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PplQ9R269 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PplQ9R269 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PplQ9R269 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PplQ9R269 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PplQ9R269 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PplQ9R269 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PplQ9R269 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PplQ9R269 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PplQ9R269 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PplQ9R269 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PplQ9R269 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PplQ9R269 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PplQ9R269 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PplQ9R269 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PplQ9R269 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PplQ9R269 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PplQ9R269 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PplQ9R269 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PplQ9R269 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PplQ9R269 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PplQ9R269 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PplQ9R269 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PplQ9R269 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PplQ9R269 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PplQ9R269 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PplQ9R269 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PplQ9R269 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PplQ9R269 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PplQ9R269 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PplQ9R269 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PplQ9R269 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PplQ9R269 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PplQ9R269 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PplQ9R269 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PplQ9R269 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PplQ9R269 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PplQ9R269 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PplQ9R269 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PplQ9R269 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PplQ9R269 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PplQ9R269 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PplQ9R269 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PplQ9R269 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PplQ9R269 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PplQ9R269 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PplQ9R269 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PplQ9R269 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PplQ9R269 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PplQ9R269 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PplQ9R269 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PplQ9R269 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PplQ9R269 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PplQ9R269 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PplQ9R269 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PplQ9R269 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PplQ9R269 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PplQ9R269 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PplQ9R269 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PplQ9R269 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PplQ9R269 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PplQ9R269 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PplQ9R269 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PplQ9R269 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PplQ9R269 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PplQ9R269 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PplQ9R269 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PplQ9R269 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PplQ9R269 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PplQ9R269 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PplQ9R269 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PplQ9R269 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PplQ9R269 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PplQ9R269 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PplQ9R269 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PplQ9R269 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PplQ9R269 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PplQ9R269 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PplQ9R269 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PplQ9R269 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PplQ9R269 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PplQ9R269 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PplQ9R269 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PplQ9R269 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PplQ9R269 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms