Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q3

Tmed2, Transmembrane emp24 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed2Q9R0Q3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmed2Q9R0Q3 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmed2Q9R0Q3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmed2Q9R0Q3 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmed2Q9R0Q3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmed2Q9R0Q3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmed2Q9R0Q3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmed2Q9R0Q3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmed2Q9R0Q3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmed2Q9R0Q3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmed2Q9R0Q3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmed2Q9R0Q3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmed2Q9R0Q3 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmed2Q9R0Q3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmed2Q9R0Q3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmed2Q9R0Q3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmed2Q9R0Q3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmed2Q9R0Q3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmed2Q9R0Q3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmed2Q9R0Q3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmed2Q9R0Q3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmed2Q9R0Q3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmed2Q9R0Q3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmed2Q9R0Q3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmed2Q9R0Q3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmed2Q9R0Q3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmed2Q9R0Q3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmed2Q9R0Q3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmed2Q9R0Q3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmed2Q9R0Q3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmed2Q9R0Q3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmed2Q9R0Q3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmed2Q9R0Q3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmed2Q9R0Q3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmed2Q9R0Q3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmed2Q9R0Q3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmed2Q9R0Q3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmed2Q9R0Q3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmed2Q9R0Q3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmed2Q9R0Q3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmed2Q9R0Q3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmed2Q9R0Q3 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmed2Q9R0Q3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmed2Q9R0Q3 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmed2Q9R0Q3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmed2Q9R0Q3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmed2Q9R0Q3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmed2Q9R0Q3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmed2Q9R0Q3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmed2Q9R0Q3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmed2Q9R0Q3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmed2Q9R0Q3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmed2Q9R0Q3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmed2Q9R0Q3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmed2Q9R0Q3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmed2Q9R0Q3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Tmed2Q9R0Q3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmed2Q9R0Q3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmed2Q9R0Q3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmed2Q9R0Q3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmed2Q9R0Q3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmed2Q9R0Q3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmed2Q9R0Q3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmed2Q9R0Q3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmed2Q9R0Q3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmed2Q9R0Q3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmed2Q9R0Q3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmed2Q9R0Q3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmed2Q9R0Q3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmed2Q9R0Q3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmed2Q9R0Q3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmed2Q9R0Q3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmed2Q9R0Q3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmed2Q9R0Q3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmed2Q9R0Q3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmed2Q9R0Q3 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmed2Q9R0Q3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmed2Q9R0Q3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmed2Q9R0Q3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmed2Q9R0Q3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmed2Q9R0Q3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmed2Q9R0Q3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmed2Q9R0Q3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmed2Q9R0Q3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmed2Q9R0Q3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmed2Q9R0Q3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmed2Q9R0Q3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmed2Q9R0Q3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmed2Q9R0Q3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmed2Q9R0Q3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmed2Q9R0Q3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmed2Q9R0Q3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmed2Q9R0Q3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmed2Q9R0Q3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmed2Q9R0Q3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmed2Q9R0Q3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmed2Q9R0Q3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmed2Q9R0Q3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmed2Q9R0Q3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmed2Q9R0Q3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms