Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G8

Nrk, Nik-related protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrkQ9R0G8 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NrkQ9R0G8 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NrkQ9R0G8 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NrkQ9R0G8 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NrkQ9R0G8 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NrkQ9R0G8 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NrkQ9R0G8 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NrkQ9R0G8 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NrkQ9R0G8 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NrkQ9R0G8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NrkQ9R0G8 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
NrkQ9R0G8 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
NrkQ9R0G8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
NrkQ9R0G8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NrkQ9R0G8 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
NrkQ9R0G8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NrkQ9R0G8 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NrkQ9R0G8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
NrkQ9R0G8 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NrkQ9R0G8 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NrkQ9R0G8 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NrkQ9R0G8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NrkQ9R0G8 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
NrkQ9R0G8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NrkQ9R0G8 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NrkQ9R0G8 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NrkQ9R0G8 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NrkQ9R0G8 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NrkQ9R0G8 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
NrkQ9R0G8 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NrkQ9R0G8 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NrkQ9R0G8 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NrkQ9R0G8 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NrkQ9R0G8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NrkQ9R0G8 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NrkQ9R0G8 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NrkQ9R0G8 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NrkQ9R0G8 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NrkQ9R0G8 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NrkQ9R0G8 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NrkQ9R0G8 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NrkQ9R0G8 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
NrkQ9R0G8 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NrkQ9R0G8 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
NrkQ9R0G8 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NrkQ9R0G8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NrkQ9R0G8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NrkQ9R0G8 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NrkQ9R0G8 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
NrkQ9R0G8 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NrkQ9R0G8 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NrkQ9R0G8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NrkQ9R0G8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NrkQ9R0G8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NrkQ9R0G8 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
NrkQ9R0G8 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NrkQ9R0G8 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NrkQ9R0G8 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NrkQ9R0G8 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NrkQ9R0G8 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
NrkQ9R0G8 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NrkQ9R0G8 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NrkQ9R0G8 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NrkQ9R0G8 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NrkQ9R0G8 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NrkQ9R0G8 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NrkQ9R0G8 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NrkQ9R0G8 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NrkQ9R0G8 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NrkQ9R0G8 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NrkQ9R0G8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NrkQ9R0G8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NrkQ9R0G8 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NrkQ9R0G8 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NrkQ9R0G8 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NrkQ9R0G8 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NrkQ9R0G8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NrkQ9R0G8 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NrkQ9R0G8 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
NrkQ9R0G8 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NrkQ9R0G8 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NrkQ9R0G8 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NrkQ9R0G8 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NrkQ9R0G8 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NrkQ9R0G8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NrkQ9R0G8 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NrkQ9R0G8 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NrkQ9R0G8 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NrkQ9R0G8 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NrkQ9R0G8 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NrkQ9R0G8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NrkQ9R0G8 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NrkQ9R0G8 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NrkQ9R0G8 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NrkQ9R0G8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NrkQ9R0G8 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NrkQ9R0G8 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
NrkQ9R0G8 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NrkQ9R0G8 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NrkQ9R0G8 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms