Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Wdr54Q9R0D8 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Wdr54Q9R0D8 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Wdr54Q9R0D8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Wdr54Q9R0D8 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Wdr54Q9R0D8 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Wdr54Q9R0D8 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Wdr54Q9R0D8 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Wdr54Q9R0D8 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Wdr54Q9R0D8 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Wdr54Q9R0D8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Wdr54Q9R0D8 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Wdr54Q9R0D8 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Wdr54Q9R0D8 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Wdr54Q9R0D8 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Wdr54Q9R0D8 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Wdr54Q9R0D8 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Wdr54Q9R0D8 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Wdr54Q9R0D8 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Wdr54Q9R0D8 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Wdr54Q9R0D8 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Wdr54Q9R0D8 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Wdr54Q9R0D8 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Wdr54Q9R0D8 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Wdr54Q9R0D8 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Wdr54Q9R0D8 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Wdr54Q9R0D8 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Wdr54Q9R0D8 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Wdr54Q9R0D8 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Wdr54Q9R0D8 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Wdr54Q9R0D8 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Wdr54Q9R0D8 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Wdr54Q9R0D8 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Wdr54Q9R0D8 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Wdr54Q9R0D8 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Wdr54Q9R0D8 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Wdr54Q9R0D8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Wdr54Q9R0D8 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Wdr54Q9R0D8 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Wdr54Q9R0D8 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Wdr54Q9R0D8 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Wdr54Q9R0D8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Wdr54Q9R0D8 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Wdr54Q9R0D8 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Wdr54Q9R0D8 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Wdr54Q9R0D8 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Wdr54Q9R0D8 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Wdr54Q9R0D8 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Wdr54Q9R0D8 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Wdr54Q9R0D8 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Wdr54Q9R0D8 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Wdr54Q9R0D8 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Wdr54Q9R0D8 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Wdr54Q9R0D8 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Wdr54Q9R0D8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Wdr54Q9R0D8 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Wdr54Q9R0D8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Wdr54Q9R0D8 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Wdr54Q9R0D8 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Wdr54Q9R0D8 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Wdr54Q9R0D8 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Wdr54Q9R0D8 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Wdr54Q9R0D8 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Wdr54Q9R0D8 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Wdr54Q9R0D8 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Wdr54Q9R0D8 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Wdr54Q9R0D8 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Wdr54Q9R0D8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Wdr54Q9R0D8 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Wdr54Q9R0D8 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Wdr54Q9R0D8 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Wdr54Q9R0D8 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Wdr54Q9R0D8 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Wdr54Q9R0D8 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Wdr54Q9R0D8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Wdr54Q9R0D8 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Wdr54Q9R0D8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Wdr54Q9R0D8 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Wdr54Q9R0D8 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Wdr54Q9R0D8 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Wdr54Q9R0D8 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Wdr54Q9R0D8 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Wdr54Q9R0D8 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Wdr54Q9R0D8 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Wdr54Q9R0D8 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Wdr54Q9R0D8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Wdr54Q9R0D8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Wdr54Q9R0D8 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Wdr54Q9R0D8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Wdr54Q9R0D8 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Wdr54Q9R0D8 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Wdr54Q9R0D8 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Wdr54Q9R0D8 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Wdr54Q9R0D8 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Wdr54Q9R0D8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Wdr54Q9R0D8 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Wdr54Q9R0D8 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Wdr54Q9R0D8 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Wdr54Q9R0D8 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Wdr54Q9R0D8 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms