Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Col4a3Q9QZS0 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Col4a3Q9QZS0 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Col4a3Q9QZS0 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Col4a3Q9QZS0 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Col4a3Q9QZS0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Col4a3Q9QZS0 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Col4a3Q9QZS0 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Col4a3Q9QZS0 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Col4a3Q9QZS0 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Col4a3Q9QZS0 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Col4a3Q9QZS0 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Col4a3Q9QZS0 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Col4a3Q9QZS0 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Col4a3Q9QZS0 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Col4a3Q9QZS0 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Col4a3Q9QZS0 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Col4a3Q9QZS0 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Col4a3Q9QZS0 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Col4a3Q9QZS0 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Col4a3Q9QZS0 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Col4a3Q9QZS0 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Col4a3Q9QZS0 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Col4a3Q9QZS0 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Col4a3Q9QZS0 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Col4a3Q9QZS0 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Col4a3Q9QZS0 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Col4a3Q9QZS0 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Col4a3Q9QZS0 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Col4a3Q9QZS0 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Col4a3Q9QZS0 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Col4a3Q9QZS0 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Col4a3Q9QZS0 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Col4a3Q9QZS0 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Col4a3Q9QZS0 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Col4a3Q9QZS0 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Col4a3Q9QZS0 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Col4a3Q9QZS0 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Col4a3Q9QZS0 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Col4a3Q9QZS0 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Col4a3Q9QZS0 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Col4a3Q9QZS0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Col4a3Q9QZS0 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Col4a3Q9QZS0 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Col4a3Q9QZS0 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Col4a3Q9QZS0 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Col4a3Q9QZS0 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Col4a3Q9QZS0 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Col4a3Q9QZS0 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Col4a3Q9QZS0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Col4a3Q9QZS0 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Col4a3Q9QZS0 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Col4a3Q9QZS0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Col4a3Q9QZS0 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Col4a3Q9QZS0 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Col4a3Q9QZS0 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Col4a3Q9QZS0 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Col4a3Q9QZS0 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Col4a3Q9QZS0 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Col4a3Q9QZS0 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Col4a3Q9QZS0 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Col4a3Q9QZS0 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Col4a3Q9QZS0 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Col4a3Q9QZS0 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Col4a3Q9QZS0 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Col4a3Q9QZS0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Col4a3Q9QZS0 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Col4a3Q9QZS0 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Col4a3Q9QZS0 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Col4a3Q9QZS0 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Col4a3Q9QZS0 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Col4a3Q9QZS0 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Col4a3Q9QZS0 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Col4a3Q9QZS0 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Col4a3Q9QZS0 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Col4a3Q9QZS0 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Col4a3Q9QZS0 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Col4a3Q9QZS0 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Col4a3Q9QZS0 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Col4a3Q9QZS0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Col4a3Q9QZS0 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Col4a3Q9QZS0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Col4a3Q9QZS0 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Col4a3Q9QZS0 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Col4a3Q9QZS0 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Col4a3Q9QZS0 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Col4a3Q9QZS0 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Col4a3Q9QZS0 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Col4a3Q9QZS0 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Col4a3Q9QZS0 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Col4a3Q9QZS0 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Col4a3Q9QZS0 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Col4a3Q9QZS0 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Col4a3Q9QZS0 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Col4a3Q9QZS0 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Col4a3Q9QZS0 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Col4a3Q9QZS0 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Col4a3Q9QZS0 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Col4a3Q9QZS0 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Col4a3Q9QZS0 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms