Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ0

Npas3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas3Q9QZQ0 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Npas3Q9QZQ0 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms