Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ubxn8Q9QZ49 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ubxn8Q9QZ49 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ubxn8Q9QZ49 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ubxn8Q9QZ49 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ubxn8Q9QZ49 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ubxn8Q9QZ49 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ubxn8Q9QZ49 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ubxn8Q9QZ49 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ubxn8Q9QZ49 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ubxn8Q9QZ49 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ubxn8Q9QZ49 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ubxn8Q9QZ49 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ubxn8Q9QZ49 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ubxn8Q9QZ49 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ubxn8Q9QZ49 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ubxn8Q9QZ49 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ubxn8Q9QZ49 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ubxn8Q9QZ49 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ubxn8Q9QZ49 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ubxn8Q9QZ49 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ubxn8Q9QZ49 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ubxn8Q9QZ49 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ubxn8Q9QZ49 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ubxn8Q9QZ49 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ubxn8Q9QZ49 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ubxn8Q9QZ49 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ubxn8Q9QZ49 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ubxn8Q9QZ49 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ubxn8Q9QZ49 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ubxn8Q9QZ49 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ubxn8Q9QZ49 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ubxn8Q9QZ49 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ubxn8Q9QZ49 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ubxn8Q9QZ49 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ubxn8Q9QZ49 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ubxn8Q9QZ49 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ubxn8Q9QZ49 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ubxn8Q9QZ49 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ubxn8Q9QZ49 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ubxn8Q9QZ49 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ubxn8Q9QZ49 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ubxn8Q9QZ49 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ubxn8Q9QZ49 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ubxn8Q9QZ49 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ubxn8Q9QZ49 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Ubxn8Q9QZ49 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ubxn8Q9QZ49 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ubxn8Q9QZ49 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ubxn8Q9QZ49 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ubxn8Q9QZ49 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ubxn8Q9QZ49 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ubxn8Q9QZ49 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ubxn8Q9QZ49 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ubxn8Q9QZ49 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Ubxn8Q9QZ49 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ubxn8Q9QZ49 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ubxn8Q9QZ49 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ubxn8Q9QZ49 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ubxn8Q9QZ49 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ubxn8Q9QZ49 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ubxn8Q9QZ49 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ubxn8Q9QZ49 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ubxn8Q9QZ49 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ubxn8Q9QZ49 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ubxn8Q9QZ49 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ubxn8Q9QZ49 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ubxn8Q9QZ49 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ubxn8Q9QZ49 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ubxn8Q9QZ49 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ubxn8Q9QZ49 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ubxn8Q9QZ49 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ubxn8Q9QZ49 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ubxn8Q9QZ49 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ubxn8Q9QZ49 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ubxn8Q9QZ49 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ubxn8Q9QZ49 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ubxn8Q9QZ49 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ubxn8Q9QZ49 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ubxn8Q9QZ49 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ubxn8Q9QZ49 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ubxn8Q9QZ49 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ubxn8Q9QZ49 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ubxn8Q9QZ49 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ubxn8Q9QZ49 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ubxn8Q9QZ49 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ubxn8Q9QZ49 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ubxn8Q9QZ49 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ubxn8Q9QZ49 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ubxn8Q9QZ49 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ubxn8Q9QZ49 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ubxn8Q9QZ49 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ubxn8Q9QZ49 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ubxn8Q9QZ49 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ubxn8Q9QZ49 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ubxn8Q9QZ49 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ubxn8Q9QZ49 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ubxn8Q9QZ49 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ubxn8Q9QZ49 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ubxn8Q9QZ49 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms