Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYM9

Tmeff2, Tomoregulin-2, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff2Q9QYM9 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmeff2Q9QYM9 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmeff2Q9QYM9 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmeff2Q9QYM9 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmeff2Q9QYM9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmeff2Q9QYM9 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmeff2Q9QYM9 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmeff2Q9QYM9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmeff2Q9QYM9 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmeff2Q9QYM9 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmeff2Q9QYM9 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmeff2Q9QYM9 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmeff2Q9QYM9 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmeff2Q9QYM9 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmeff2Q9QYM9 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmeff2Q9QYM9 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmeff2Q9QYM9 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmeff2Q9QYM9 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmeff2Q9QYM9 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmeff2Q9QYM9 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmeff2Q9QYM9 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmeff2Q9QYM9 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmeff2Q9QYM9 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmeff2Q9QYM9 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmeff2Q9QYM9 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmeff2Q9QYM9 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmeff2Q9QYM9 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmeff2Q9QYM9 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmeff2Q9QYM9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmeff2Q9QYM9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmeff2Q9QYM9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmeff2Q9QYM9 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmeff2Q9QYM9 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmeff2Q9QYM9 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmeff2Q9QYM9 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmeff2Q9QYM9 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmeff2Q9QYM9 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmeff2Q9QYM9 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmeff2Q9QYM9 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmeff2Q9QYM9 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmeff2Q9QYM9 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmeff2Q9QYM9 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmeff2Q9QYM9 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmeff2Q9QYM9 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmeff2Q9QYM9 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmeff2Q9QYM9 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmeff2Q9QYM9 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmeff2Q9QYM9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmeff2Q9QYM9 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmeff2Q9QYM9 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmeff2Q9QYM9 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmeff2Q9QYM9 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmeff2Q9QYM9 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tmeff2Q9QYM9 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmeff2Q9QYM9 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmeff2Q9QYM9 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmeff2Q9QYM9 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmeff2Q9QYM9 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmeff2Q9QYM9 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmeff2Q9QYM9 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmeff2Q9QYM9 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmeff2Q9QYM9 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmeff2Q9QYM9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmeff2Q9QYM9 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmeff2Q9QYM9 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmeff2Q9QYM9 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmeff2Q9QYM9 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmeff2Q9QYM9 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmeff2Q9QYM9 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmeff2Q9QYM9 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmeff2Q9QYM9 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmeff2Q9QYM9 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmeff2Q9QYM9 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmeff2Q9QYM9 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmeff2Q9QYM9 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmeff2Q9QYM9 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmeff2Q9QYM9 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmeff2Q9QYM9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmeff2Q9QYM9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmeff2Q9QYM9 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmeff2Q9QYM9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmeff2Q9QYM9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmeff2Q9QYM9 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmeff2Q9QYM9 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmeff2Q9QYM9 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmeff2Q9QYM9 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmeff2Q9QYM9 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmeff2Q9QYM9 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmeff2Q9QYM9 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmeff2Q9QYM9 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmeff2Q9QYM9 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmeff2Q9QYM9 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmeff2Q9QYM9 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmeff2Q9QYM9 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmeff2Q9QYM9 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmeff2Q9QYM9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmeff2Q9QYM9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmeff2Q9QYM9 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmeff2Q9QYM9 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmeff2Q9QYM9 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms