Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VapbQ9QY76 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VapbQ9QY76 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VapbQ9QY76 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VapbQ9QY76 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VapbQ9QY76 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VapbQ9QY76 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VapbQ9QY76 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VapbQ9QY76 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VapbQ9QY76 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VapbQ9QY76 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VapbQ9QY76 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VapbQ9QY76 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VapbQ9QY76 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VapbQ9QY76 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VapbQ9QY76 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VapbQ9QY76 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VapbQ9QY76 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VapbQ9QY76 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VapbQ9QY76 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VapbQ9QY76 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VapbQ9QY76 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VapbQ9QY76 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VapbQ9QY76 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VapbQ9QY76 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VapbQ9QY76 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VapbQ9QY76 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VapbQ9QY76 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VapbQ9QY76 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VapbQ9QY76 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VapbQ9QY76 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VapbQ9QY76 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VapbQ9QY76 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VapbQ9QY76 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VapbQ9QY76 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VapbQ9QY76 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VapbQ9QY76 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VapbQ9QY76 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VapbQ9QY76 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VapbQ9QY76 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VapbQ9QY76 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VapbQ9QY76 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VapbQ9QY76 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VapbQ9QY76 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VapbQ9QY76 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VapbQ9QY76 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VapbQ9QY76 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VapbQ9QY76 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VapbQ9QY76 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VapbQ9QY76 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VapbQ9QY76 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VapbQ9QY76 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VapbQ9QY76 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VapbQ9QY76 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VapbQ9QY76 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VapbQ9QY76 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VapbQ9QY76 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VapbQ9QY76 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VapbQ9QY76 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VapbQ9QY76 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VapbQ9QY76 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VapbQ9QY76 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VapbQ9QY76 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VapbQ9QY76 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VapbQ9QY76 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VapbQ9QY76 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VapbQ9QY76 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VapbQ9QY76 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VapbQ9QY76 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VapbQ9QY76 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
VapbQ9QY76 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VapbQ9QY76 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VapbQ9QY76 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VapbQ9QY76 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VapbQ9QY76 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VapbQ9QY76 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VapbQ9QY76 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VapbQ9QY76 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VapbQ9QY76 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VapbQ9QY76 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VapbQ9QY76 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VapbQ9QY76 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VapbQ9QY76 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VapbQ9QY76 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VapbQ9QY76 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VapbQ9QY76 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VapbQ9QY76 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VapbQ9QY76 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VapbQ9QY76 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
VapbQ9QY76 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VapbQ9QY76 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VapbQ9QY76 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VapbQ9QY76 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
VapbQ9QY76 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VapbQ9QY76 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VapbQ9QY76 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VapbQ9QY76 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VapbQ9QY76 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VapbQ9QY76 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VapbQ9QY76 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms