Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkp3Q9QY23 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkp3Q9QY23 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkp3Q9QY23 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkp3Q9QY23 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkp3Q9QY23 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkp3Q9QY23 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkp3Q9QY23 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkp3Q9QY23 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkp3Q9QY23 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkp3Q9QY23 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkp3Q9QY23 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkp3Q9QY23 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkp3Q9QY23 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkp3Q9QY23 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkp3Q9QY23 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkp3Q9QY23 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkp3Q9QY23 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkp3Q9QY23 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkp3Q9QY23 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkp3Q9QY23 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkp3Q9QY23 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkp3Q9QY23 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkp3Q9QY23 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkp3Q9QY23 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkp3Q9QY23 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkp3Q9QY23 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkp3Q9QY23 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkp3Q9QY23 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkp3Q9QY23 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkp3Q9QY23 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkp3Q9QY23 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkp3Q9QY23 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkp3Q9QY23 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkp3Q9QY23 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkp3Q9QY23 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkp3Q9QY23 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkp3Q9QY23 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkp3Q9QY23 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkp3Q9QY23 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkp3Q9QY23 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkp3Q9QY23 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkp3Q9QY23 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkp3Q9QY23 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkp3Q9QY23 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkp3Q9QY23 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pkp3Q9QY23 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pkp3Q9QY23 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pkp3Q9QY23 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pkp3Q9QY23 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pkp3Q9QY23 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pkp3Q9QY23 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pkp3Q9QY23 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pkp3Q9QY23 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pkp3Q9QY23 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pkp3Q9QY23 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pkp3Q9QY23 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pkp3Q9QY23 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pkp3Q9QY23 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pkp3Q9QY23 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pkp3Q9QY23 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pkp3Q9QY23 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pkp3Q9QY23 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pkp3Q9QY23 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pkp3Q9QY23 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Pkp3Q9QY23 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pkp3Q9QY23 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pkp3Q9QY23 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Pkp3Q9QY23 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pkp3Q9QY23 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pkp3Q9QY23 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pkp3Q9QY23 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pkp3Q9QY23 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pkp3Q9QY23 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pkp3Q9QY23 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pkp3Q9QY23 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Pkp3Q9QY23 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Pkp3Q9QY23 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pkp3Q9QY23 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pkp3Q9QY23 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pkp3Q9QY23 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pkp3Q9QY23 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pkp3Q9QY23 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pkp3Q9QY23 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pkp3Q9QY23 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pkp3Q9QY23 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pkp3Q9QY23 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pkp3Q9QY23 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Pkp3Q9QY23 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pkp3Q9QY23 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pkp3Q9QY23 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pkp3Q9QY23 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pkp3Q9QY23 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pkp3Q9QY23 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pkp3Q9QY23 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pkp3Q9QY23 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pkp3Q9QY23 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pkp3Q9QY23 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pkp3Q9QY23 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pkp3Q9QY23 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms