Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXX8

Nufip1, Nuclear fragile X mental retardation-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nufip1Q9QXX8 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nufip1Q9QXX8 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nufip1Q9QXX8 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nufip1Q9QXX8 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nufip1Q9QXX8 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nufip1Q9QXX8 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nufip1Q9QXX8 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nufip1Q9QXX8 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nufip1Q9QXX8 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nufip1Q9QXX8 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nufip1Q9QXX8 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nufip1Q9QXX8 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nufip1Q9QXX8 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nufip1Q9QXX8 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nufip1Q9QXX8 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nufip1Q9QXX8 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nufip1Q9QXX8 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms