Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cbx8Q9QXV1 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cbx8Q9QXV1 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cbx8Q9QXV1 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cbx8Q9QXV1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cbx8Q9QXV1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cbx8Q9QXV1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Cbx8Q9QXV1 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cbx8Q9QXV1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cbx8Q9QXV1 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cbx8Q9QXV1 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cbx8Q9QXV1 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cbx8Q9QXV1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cbx8Q9QXV1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cbx8Q9QXV1 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cbx8Q9QXV1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cbx8Q9QXV1 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cbx8Q9QXV1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cbx8Q9QXV1 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cbx8Q9QXV1 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cbx8Q9QXV1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cbx8Q9QXV1 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cbx8Q9QXV1 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cbx8Q9QXV1 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cbx8Q9QXV1 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cbx8Q9QXV1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cbx8Q9QXV1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cbx8Q9QXV1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cbx8Q9QXV1 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cbx8Q9QXV1 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cbx8Q9QXV1 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cbx8Q9QXV1 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cbx8Q9QXV1 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Cbx8Q9QXV1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cbx8Q9QXV1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cbx8Q9QXV1 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cbx8Q9QXV1 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cbx8Q9QXV1 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cbx8Q9QXV1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cbx8Q9QXV1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cbx8Q9QXV1 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cbx8Q9QXV1 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cbx8Q9QXV1 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Cbx8Q9QXV1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Cbx8Q9QXV1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cbx8Q9QXV1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cbx8Q9QXV1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cbx8Q9QXV1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Cbx8Q9QXV1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cbx8Q9QXV1 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cbx8Q9QXV1 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cbx8Q9QXV1 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cbx8Q9QXV1 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cbx8Q9QXV1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cbx8Q9QXV1 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Cbx8Q9QXV1 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cbx8Q9QXV1 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cbx8Q9QXV1 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cbx8Q9QXV1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Cbx8Q9QXV1 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cbx8Q9QXV1 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cbx8Q9QXV1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cbx8Q9QXV1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cbx8Q9QXV1 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cbx8Q9QXV1 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cbx8Q9QXV1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cbx8Q9QXV1 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cbx8Q9QXV1 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cbx8Q9QXV1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cbx8Q9QXV1 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cbx8Q9QXV1 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cbx8Q9QXV1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cbx8Q9QXV1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cbx8Q9QXV1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cbx8Q9QXV1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cbx8Q9QXV1 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Cbx8Q9QXV1 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Cbx8Q9QXV1 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cbx8Q9QXV1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cbx8Q9QXV1 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cbx8Q9QXV1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Cbx8Q9QXV1 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cbx8Q9QXV1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cbx8Q9QXV1 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cbx8Q9QXV1 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cbx8Q9QXV1 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cbx8Q9QXV1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cbx8Q9QXV1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Cbx8Q9QXV1 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Cbx8Q9QXV1 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cbx8Q9QXV1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cbx8Q9QXV1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cbx8Q9QXV1 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cbx8Q9QXV1 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cbx8Q9QXV1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cbx8Q9QXV1 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cbx8Q9QXV1 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cbx8Q9QXV1 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cbx8Q9QXV1 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cbx8Q9QXV1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms