Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV0

Pcsk1n, ProSAAS, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk1nQ9QXV0 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcsk1nQ9QXV0 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcsk1nQ9QXV0 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcsk1nQ9QXV0 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcsk1nQ9QXV0 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcsk1nQ9QXV0 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcsk1nQ9QXV0 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcsk1nQ9QXV0 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcsk1nQ9QXV0 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcsk1nQ9QXV0 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcsk1nQ9QXV0 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcsk1nQ9QXV0 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcsk1nQ9QXV0 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcsk1nQ9QXV0 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcsk1nQ9QXV0 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcsk1nQ9QXV0 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcsk1nQ9QXV0 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcsk1nQ9QXV0 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcsk1nQ9QXV0 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcsk1nQ9QXV0 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcsk1nQ9QXV0 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcsk1nQ9QXV0 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcsk1nQ9QXV0 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcsk1nQ9QXV0 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcsk1nQ9QXV0 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcsk1nQ9QXV0 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcsk1nQ9QXV0 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcsk1nQ9QXV0 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcsk1nQ9QXV0 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcsk1nQ9QXV0 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcsk1nQ9QXV0 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcsk1nQ9QXV0 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcsk1nQ9QXV0 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcsk1nQ9QXV0 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcsk1nQ9QXV0 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcsk1nQ9QXV0 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcsk1nQ9QXV0 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcsk1nQ9QXV0 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcsk1nQ9QXV0 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcsk1nQ9QXV0 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcsk1nQ9QXV0 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcsk1nQ9QXV0 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcsk1nQ9QXV0 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcsk1nQ9QXV0 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcsk1nQ9QXV0 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcsk1nQ9QXV0 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Pcsk1nQ9QXV0 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pcsk1nQ9QXV0 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pcsk1nQ9QXV0 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pcsk1nQ9QXV0 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pcsk1nQ9QXV0 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Pcsk1nQ9QXV0 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pcsk1nQ9QXV0 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pcsk1nQ9QXV0 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pcsk1nQ9QXV0 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Pcsk1nQ9QXV0 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pcsk1nQ9QXV0 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pcsk1nQ9QXV0 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pcsk1nQ9QXV0 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pcsk1nQ9QXV0 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pcsk1nQ9QXV0 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pcsk1nQ9QXV0 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pcsk1nQ9QXV0 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pcsk1nQ9QXV0 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pcsk1nQ9QXV0 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pcsk1nQ9QXV0 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pcsk1nQ9QXV0 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pcsk1nQ9QXV0 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pcsk1nQ9QXV0 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pcsk1nQ9QXV0 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pcsk1nQ9QXV0 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pcsk1nQ9QXV0 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pcsk1nQ9QXV0 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pcsk1nQ9QXV0 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pcsk1nQ9QXV0 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pcsk1nQ9QXV0 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pcsk1nQ9QXV0 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pcsk1nQ9QXV0 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Pcsk1nQ9QXV0 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pcsk1nQ9QXV0 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Pcsk1nQ9QXV0 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pcsk1nQ9QXV0 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pcsk1nQ9QXV0 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pcsk1nQ9QXV0 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pcsk1nQ9QXV0 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pcsk1nQ9QXV0 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pcsk1nQ9QXV0 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pcsk1nQ9QXV0 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pcsk1nQ9QXV0 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pcsk1nQ9QXV0 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pcsk1nQ9QXV0 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Pcsk1nQ9QXV0 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pcsk1nQ9QXV0 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pcsk1nQ9QXV0 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pcsk1nQ9QXV0 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pcsk1nQ9QXV0 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pcsk1nQ9QXV0 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pcsk1nQ9QXV0 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pcsk1nQ9QXV0 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pcsk1nQ9QXV0 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms