Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXN3

Trip4, Activating signal cointegrator 1, mousemouse

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip4Q9QXN3 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Trip4Q9QXN3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trip4Q9QXN3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trip4Q9QXN3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trip4Q9QXN3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trip4Q9QXN3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trip4Q9QXN3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trip4Q9QXN3 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trip4Q9QXN3 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trip4Q9QXN3 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trip4Q9QXN3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trip4Q9QXN3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trip4Q9QXN3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Trip4Q9QXN3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trip4Q9QXN3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trip4Q9QXN3 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trip4Q9QXN3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trip4Q9QXN3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trip4Q9QXN3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trip4Q9QXN3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trip4Q9QXN3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trip4Q9QXN3 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Trip4Q9QXN3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trip4Q9QXN3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trip4Q9QXN3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trip4Q9QXN3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trip4Q9QXN3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trip4Q9QXN3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trip4Q9QXN3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trip4Q9QXN3 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Trip4Q9QXN3 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Trip4Q9QXN3 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trip4Q9QXN3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trip4Q9QXN3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trip4Q9QXN3 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trip4Q9QXN3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trip4Q9QXN3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trip4Q9QXN3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trip4Q9QXN3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trip4Q9QXN3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trip4Q9QXN3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trip4Q9QXN3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trip4Q9QXN3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trip4Q9QXN3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trip4Q9QXN3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trip4Q9QXN3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trip4Q9QXN3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trip4Q9QXN3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trip4Q9QXN3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trip4Q9QXN3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Trip4Q9QXN3 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trip4Q9QXN3 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trip4Q9QXN3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trip4Q9QXN3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trip4Q9QXN3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trip4Q9QXN3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trip4Q9QXN3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trip4Q9QXN3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trip4Q9QXN3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trip4Q9QXN3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trip4Q9QXN3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trip4Q9QXN3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trip4Q9QXN3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trip4Q9QXN3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trip4Q9QXN3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trip4Q9QXN3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trip4Q9QXN3 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Trip4Q9QXN3 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trip4Q9QXN3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trip4Q9QXN3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trip4Q9QXN3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trip4Q9QXN3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trip4Q9QXN3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trip4Q9QXN3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trip4Q9QXN3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trip4Q9QXN3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trip4Q9QXN3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trip4Q9QXN3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trip4Q9QXN3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trip4Q9QXN3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trip4Q9QXN3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Trip4Q9QXN3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trip4Q9QXN3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trip4Q9QXN3 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trip4Q9QXN3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trip4Q9QXN3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trip4Q9QXN3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trip4Q9QXN3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trip4Q9QXN3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trip4Q9QXN3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trip4Q9QXN3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trip4Q9QXN3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trip4Q9QXN3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trip4Q9QXN3 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trip4Q9QXN3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trip4Q9QXN3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trip4Q9QXN3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trip4Q9QXN3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trip4Q9QXN3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trip4Q9QXN3 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms