Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE4

Trp53inp1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53inp1Q9QXE4 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trp53inp1Q9QXE4 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trp53inp1Q9QXE4 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trp53inp1Q9QXE4 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trp53inp1Q9QXE4 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trp53inp1Q9QXE4 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Trp53inp1Q9QXE4 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trp53inp1Q9QXE4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trp53inp1Q9QXE4 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trp53inp1Q9QXE4 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trp53inp1Q9QXE4 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trp53inp1Q9QXE4 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trp53inp1Q9QXE4 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trp53inp1Q9QXE4 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trp53inp1Q9QXE4 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trp53inp1Q9QXE4 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trp53inp1Q9QXE4 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trp53inp1Q9QXE4 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trp53inp1Q9QXE4 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trp53inp1Q9QXE4 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trp53inp1Q9QXE4 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trp53inp1Q9QXE4 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trp53inp1Q9QXE4 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trp53inp1Q9QXE4 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trp53inp1Q9QXE4 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trp53inp1Q9QXE4 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trp53inp1Q9QXE4 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trp53inp1Q9QXE4 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trp53inp1Q9QXE4 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trp53inp1Q9QXE4 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trp53inp1Q9QXE4 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trp53inp1Q9QXE4 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trp53inp1Q9QXE4 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trp53inp1Q9QXE4 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trp53inp1Q9QXE4 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trp53inp1Q9QXE4 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trp53inp1Q9QXE4 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trp53inp1Q9QXE4 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trp53inp1Q9QXE4 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trp53inp1Q9QXE4 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trp53inp1Q9QXE4 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trp53inp1Q9QXE4 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trp53inp1Q9QXE4 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trp53inp1Q9QXE4 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trp53inp1Q9QXE4 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trp53inp1Q9QXE4 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trp53inp1Q9QXE4 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trp53inp1Q9QXE4 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trp53inp1Q9QXE4 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trp53inp1Q9QXE4 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trp53inp1Q9QXE4 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trp53inp1Q9QXE4 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trp53inp1Q9QXE4 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trp53inp1Q9QXE4 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trp53inp1Q9QXE4 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trp53inp1Q9QXE4 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trp53inp1Q9QXE4 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trp53inp1Q9QXE4 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trp53inp1Q9QXE4 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trp53inp1Q9QXE4 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trp53inp1Q9QXE4 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Trp53inp1Q9QXE4 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Trp53inp1Q9QXE4 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Trp53inp1Q9QXE4 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trp53inp1Q9QXE4 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trp53inp1Q9QXE4 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trp53inp1Q9QXE4 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trp53inp1Q9QXE4 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trp53inp1Q9QXE4 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trp53inp1Q9QXE4 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trp53inp1Q9QXE4 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trp53inp1Q9QXE4 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Trp53inp1Q9QXE4 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trp53inp1Q9QXE4 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trp53inp1Q9QXE4 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trp53inp1Q9QXE4 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trp53inp1Q9QXE4 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trp53inp1Q9QXE4 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Trp53inp1Q9QXE4 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Trp53inp1Q9QXE4 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Trp53inp1Q9QXE4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trp53inp1Q9QXE4 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trp53inp1Q9QXE4 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trp53inp1Q9QXE4 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trp53inp1Q9QXE4 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trp53inp1Q9QXE4 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trp53inp1Q9QXE4 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trp53inp1Q9QXE4 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trp53inp1Q9QXE4 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trp53inp1Q9QXE4 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trp53inp1Q9QXE4 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trp53inp1Q9QXE4 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trp53inp1Q9QXE4 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trp53inp1Q9QXE4 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trp53inp1Q9QXE4 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trp53inp1Q9QXE4 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trp53inp1Q9QXE4 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trp53inp1Q9QXE4 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trp53inp1Q9QXE4 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms