Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim44Q9QXA7 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim44Q9QXA7 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim44Q9QXA7 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim44Q9QXA7 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim44Q9QXA7 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim44Q9QXA7 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim44Q9QXA7 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim44Q9QXA7 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim44Q9QXA7 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim44Q9QXA7 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim44Q9QXA7 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim44Q9QXA7 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim44Q9QXA7 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim44Q9QXA7 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim44Q9QXA7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim44Q9QXA7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim44Q9QXA7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim44Q9QXA7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim44Q9QXA7 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim44Q9QXA7 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim44Q9QXA7 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim44Q9QXA7 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim44Q9QXA7 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim44Q9QXA7 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim44Q9QXA7 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim44Q9QXA7 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim44Q9QXA7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim44Q9QXA7 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim44Q9QXA7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim44Q9QXA7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim44Q9QXA7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim44Q9QXA7 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim44Q9QXA7 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim44Q9QXA7 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim44Q9QXA7 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim44Q9QXA7 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim44Q9QXA7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim44Q9QXA7 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim44Q9QXA7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim44Q9QXA7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim44Q9QXA7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim44Q9QXA7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim44Q9QXA7 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim44Q9QXA7 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim44Q9QXA7 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim44Q9QXA7 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim44Q9QXA7 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim44Q9QXA7 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim44Q9QXA7 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim44Q9QXA7 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim44Q9QXA7 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim44Q9QXA7 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim44Q9QXA7 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim44Q9QXA7 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim44Q9QXA7 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim44Q9QXA7 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim44Q9QXA7 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim44Q9QXA7 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim44Q9QXA7 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim44Q9QXA7 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim44Q9QXA7 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim44Q9QXA7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim44Q9QXA7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim44Q9QXA7 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim44Q9QXA7 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim44Q9QXA7 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim44Q9QXA7 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim44Q9QXA7 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim44Q9QXA7 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim44Q9QXA7 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim44Q9QXA7 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim44Q9QXA7 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim44Q9QXA7 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim44Q9QXA7 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim44Q9QXA7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim44Q9QXA7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim44Q9QXA7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim44Q9QXA7 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim44Q9QXA7 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim44Q9QXA7 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim44Q9QXA7 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim44Q9QXA7 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim44Q9QXA7 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim44Q9QXA7 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim44Q9QXA7 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim44Q9QXA7 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim44Q9QXA7 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim44Q9QXA7 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim44Q9QXA7 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim44Q9QXA7 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim44Q9QXA7 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim44Q9QXA7 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim44Q9QXA7 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim44Q9QXA7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim44Q9QXA7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim44Q9QXA7 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim44Q9QXA7 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim44Q9QXA7 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim44Q9QXA7 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms