Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA5

Lsm4, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm4Q9QXA5 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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