Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWL7

Krt17, Keratin, type I cytoskeletal 17, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt17Q9QWL7 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Krt17Q9QWL7 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Krt17Q9QWL7 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Krt17Q9QWL7 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Krt17Q9QWL7 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Krt17Q9QWL7 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Krt17Q9QWL7 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Krt17Q9QWL7 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Krt17Q9QWL7 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Krt17Q9QWL7 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Krt17Q9QWL7 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Krt17Q9QWL7 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Krt17Q9QWL7 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Krt17Q9QWL7 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Krt17Q9QWL7 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Krt17Q9QWL7 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Krt17Q9QWL7 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Krt17Q9QWL7 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Krt17Q9QWL7 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Krt17Q9QWL7 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Krt17Q9QWL7 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt17Q9QWL7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt17Q9QWL7 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt17Q9QWL7 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt17Q9QWL7 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt17Q9QWL7 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt17Q9QWL7 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt17Q9QWL7 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt17Q9QWL7 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt17Q9QWL7 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt17Q9QWL7 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt17Q9QWL7 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt17Q9QWL7 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt17Q9QWL7 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Krt17Q9QWL7 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Krt17Q9QWL7 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Krt17Q9QWL7 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Krt17Q9QWL7 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Krt17Q9QWL7 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Krt17Q9QWL7 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Krt17Q9QWL7 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Krt17Q9QWL7 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Krt17Q9QWL7 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Krt17Q9QWL7 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Krt17Q9QWL7 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Krt17Q9QWL7 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Krt17Q9QWL7 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Krt17Q9QWL7 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Krt17Q9QWL7 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Krt17Q9QWL7 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Krt17Q9QWL7 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Krt17Q9QWL7 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Krt17Q9QWL7 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Krt17Q9QWL7 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Krt17Q9QWL7 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Krt17Q9QWL7 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Krt17Q9QWL7 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Krt17Q9QWL7 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Krt17Q9QWL7 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Krt17Q9QWL7 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Krt17Q9QWL7 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Krt17Q9QWL7 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Krt17Q9QWL7 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Krt17Q9QWL7 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Krt17Q9QWL7 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Krt17Q9QWL7 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Krt17Q9QWL7 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Krt17Q9QWL7 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Krt17Q9QWL7 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Krt17Q9QWL7 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Krt17Q9QWL7 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Krt17Q9QWL7 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Krt17Q9QWL7 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Krt17Q9QWL7 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Krt17Q9QWL7 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Krt17Q9QWL7 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Krt17Q9QWL7 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Krt17Q9QWL7 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Krt17Q9QWL7 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Krt17Q9QWL7 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Krt17Q9QWL7 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Krt17Q9QWL7 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Krt17Q9QWL7 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Krt17Q9QWL7 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Krt17Q9QWL7 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Krt17Q9QWL7 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Krt17Q9QWL7 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Krt17Q9QWL7 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Krt17Q9QWL7 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Krt17Q9QWL7 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Krt17Q9QWL7 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Krt17Q9QWL7 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Krt17Q9QWL7 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Krt17Q9QWL7 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Krt17Q9QWL7 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Krt17Q9QWL7 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Krt17Q9QWL7 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Krt17Q9QWL7 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Krt17Q9QWL7 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Krt17Q9QWL7 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms