Protein–RNA interactions for Protein: Q9QW08

Pdc, Phosducin, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdcQ9QW08 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PdcQ9QW08 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PdcQ9QW08 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PdcQ9QW08 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PdcQ9QW08 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PdcQ9QW08 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PdcQ9QW08 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PdcQ9QW08 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PdcQ9QW08 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PdcQ9QW08 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PdcQ9QW08 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PdcQ9QW08 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PdcQ9QW08 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PdcQ9QW08 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PdcQ9QW08 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PdcQ9QW08 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PdcQ9QW08 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PdcQ9QW08 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PdcQ9QW08 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PdcQ9QW08 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PdcQ9QW08 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PdcQ9QW08 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PdcQ9QW08 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PdcQ9QW08 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PdcQ9QW08 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PdcQ9QW08 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PdcQ9QW08 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PdcQ9QW08 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PdcQ9QW08 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PdcQ9QW08 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PdcQ9QW08 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PdcQ9QW08 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PdcQ9QW08 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PdcQ9QW08 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PdcQ9QW08 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PdcQ9QW08 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PdcQ9QW08 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PdcQ9QW08 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PdcQ9QW08 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PdcQ9QW08 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PdcQ9QW08 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PdcQ9QW08 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PdcQ9QW08 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PdcQ9QW08 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PdcQ9QW08 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PdcQ9QW08 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PdcQ9QW08 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PdcQ9QW08 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PdcQ9QW08 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PdcQ9QW08 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PdcQ9QW08 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PdcQ9QW08 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PdcQ9QW08 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PdcQ9QW08 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PdcQ9QW08 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PdcQ9QW08 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PdcQ9QW08 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PdcQ9QW08 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PdcQ9QW08 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PdcQ9QW08 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PdcQ9QW08 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PdcQ9QW08 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PdcQ9QW08 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PdcQ9QW08 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PdcQ9QW08 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PdcQ9QW08 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PdcQ9QW08 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PdcQ9QW08 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PdcQ9QW08 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PdcQ9QW08 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PdcQ9QW08 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PdcQ9QW08 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PdcQ9QW08 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PdcQ9QW08 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PdcQ9QW08 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PdcQ9QW08 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PdcQ9QW08 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PdcQ9QW08 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PdcQ9QW08 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PdcQ9QW08 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PdcQ9QW08 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PdcQ9QW08 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PdcQ9QW08 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PdcQ9QW08 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PdcQ9QW08 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PdcQ9QW08 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PdcQ9QW08 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PdcQ9QW08 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PdcQ9QW08 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PdcQ9QW08 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PdcQ9QW08 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PdcQ9QW08 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PdcQ9QW08 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PdcQ9QW08 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PdcQ9QW08 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PdcQ9QW08 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PdcQ9QW08 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PdcQ9QW08 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PdcQ9QW08 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PdcQ9QW08 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms