Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUM7

Msh5, MutS protein homolog 5, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msh5Q9QUM7 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msh5Q9QUM7 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msh5Q9QUM7 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msh5Q9QUM7 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msh5Q9QUM7 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msh5Q9QUM7 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msh5Q9QUM7 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msh5Q9QUM7 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Msh5Q9QUM7 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Msh5Q9QUM7 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Msh5Q9QUM7 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Msh5Q9QUM7 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Msh5Q9QUM7 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Msh5Q9QUM7 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Msh5Q9QUM7 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Msh5Q9QUM7 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Msh5Q9QUM7 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Msh5Q9QUM7 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Msh5Q9QUM7 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Msh5Q9QUM7 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Msh5Q9QUM7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Msh5Q9QUM7 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Msh5Q9QUM7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Msh5Q9QUM7 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Msh5Q9QUM7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Msh5Q9QUM7 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Msh5Q9QUM7 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Msh5Q9QUM7 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Msh5Q9QUM7 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Msh5Q9QUM7 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Msh5Q9QUM7 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Msh5Q9QUM7 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Msh5Q9QUM7 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Msh5Q9QUM7 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Msh5Q9QUM7 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Msh5Q9QUM7 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Msh5Q9QUM7 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Msh5Q9QUM7 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Msh5Q9QUM7 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Msh5Q9QUM7 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Msh5Q9QUM7 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Msh5Q9QUM7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Msh5Q9QUM7 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Msh5Q9QUM7 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Msh5Q9QUM7 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Msh5Q9QUM7 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Msh5Q9QUM7 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Msh5Q9QUM7 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Msh5Q9QUM7 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Msh5Q9QUM7 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Msh5Q9QUM7 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Msh5Q9QUM7 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Msh5Q9QUM7 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Msh5Q9QUM7 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Msh5Q9QUM7 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Msh5Q9QUM7 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Msh5Q9QUM7 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Msh5Q9QUM7 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Msh5Q9QUM7 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Msh5Q9QUM7 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Msh5Q9QUM7 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Msh5Q9QUM7 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Msh5Q9QUM7 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Msh5Q9QUM7 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Msh5Q9QUM7 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Msh5Q9QUM7 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Msh5Q9QUM7 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Msh5Q9QUM7 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Msh5Q9QUM7 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Msh5Q9QUM7 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Msh5Q9QUM7 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Msh5Q9QUM7 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Msh5Q9QUM7 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Msh5Q9QUM7 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Msh5Q9QUM7 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Msh5Q9QUM7 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Msh5Q9QUM7 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Msh5Q9QUM7 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Msh5Q9QUM7 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Msh5Q9QUM7 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Msh5Q9QUM7 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Msh5Q9QUM7 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Msh5Q9QUM7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Msh5Q9QUM7 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Msh5Q9QUM7 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Msh5Q9QUM7 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Msh5Q9QUM7 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Msh5Q9QUM7 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Msh5Q9QUM7 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Msh5Q9QUM7 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Msh5Q9QUM7 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Msh5Q9QUM7 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Msh5Q9QUM7 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Msh5Q9QUM7 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Msh5Q9QUM7 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Msh5Q9QUM7 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Msh5Q9QUM7 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Msh5Q9QUM7 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Msh5Q9QUM7 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Msh5Q9QUM7 Gm42726-201ENSMUST00000202274 1286 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.6 ms