Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK0

Cdkl2, Cyclin-dependent kinase-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl2Q9QUK0 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdkl2Q9QUK0 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdkl2Q9QUK0 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdkl2Q9QUK0 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdkl2Q9QUK0 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdkl2Q9QUK0 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdkl2Q9QUK0 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdkl2Q9QUK0 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdkl2Q9QUK0 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdkl2Q9QUK0 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdkl2Q9QUK0 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdkl2Q9QUK0 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdkl2Q9QUK0 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdkl2Q9QUK0 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdkl2Q9QUK0 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdkl2Q9QUK0 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdkl2Q9QUK0 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdkl2Q9QUK0 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdkl2Q9QUK0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdkl2Q9QUK0 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdkl2Q9QUK0 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdkl2Q9QUK0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdkl2Q9QUK0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdkl2Q9QUK0 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdkl2Q9QUK0 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdkl2Q9QUK0 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdkl2Q9QUK0 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdkl2Q9QUK0 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdkl2Q9QUK0 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdkl2Q9QUK0 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdkl2Q9QUK0 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cdkl2Q9QUK0 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cdkl2Q9QUK0 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cdkl2Q9QUK0 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cdkl2Q9QUK0 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cdkl2Q9QUK0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cdkl2Q9QUK0 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cdkl2Q9QUK0 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cdkl2Q9QUK0 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cdkl2Q9QUK0 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cdkl2Q9QUK0 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cdkl2Q9QUK0 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cdkl2Q9QUK0 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cdkl2Q9QUK0 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cdkl2Q9QUK0 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Cdkl2Q9QUK0 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cdkl2Q9QUK0 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cdkl2Q9QUK0 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cdkl2Q9QUK0 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cdkl2Q9QUK0 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cdkl2Q9QUK0 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cdkl2Q9QUK0 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cdkl2Q9QUK0 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cdkl2Q9QUK0 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Cdkl2Q9QUK0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cdkl2Q9QUK0 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cdkl2Q9QUK0 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cdkl2Q9QUK0 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cdkl2Q9QUK0 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cdkl2Q9QUK0 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cdkl2Q9QUK0 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cdkl2Q9QUK0 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cdkl2Q9QUK0 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cdkl2Q9QUK0 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cdkl2Q9QUK0 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cdkl2Q9QUK0 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cdkl2Q9QUK0 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cdkl2Q9QUK0 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cdkl2Q9QUK0 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cdkl2Q9QUK0 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cdkl2Q9QUK0 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cdkl2Q9QUK0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cdkl2Q9QUK0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cdkl2Q9QUK0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Cdkl2Q9QUK0 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cdkl2Q9QUK0 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cdkl2Q9QUK0 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cdkl2Q9QUK0 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cdkl2Q9QUK0 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cdkl2Q9QUK0 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cdkl2Q9QUK0 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Cdkl2Q9QUK0 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cdkl2Q9QUK0 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cdkl2Q9QUK0 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cdkl2Q9QUK0 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cdkl2Q9QUK0 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cdkl2Q9QUK0 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cdkl2Q9QUK0 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cdkl2Q9QUK0 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cdkl2Q9QUK0 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cdkl2Q9QUK0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cdkl2Q9QUK0 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cdkl2Q9QUK0 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cdkl2Q9QUK0 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cdkl2Q9QUK0 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cdkl2Q9QUK0 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cdkl2Q9QUK0 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cdkl2Q9QUK0 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cdkl2Q9QUK0 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cdkl2Q9QUK0 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms