Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SrfQ9JM73 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SrfQ9JM73 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SrfQ9JM73 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SrfQ9JM73 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SrfQ9JM73 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SrfQ9JM73 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SrfQ9JM73 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SrfQ9JM73 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SrfQ9JM73 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SrfQ9JM73 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SrfQ9JM73 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SrfQ9JM73 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SrfQ9JM73 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SrfQ9JM73 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SrfQ9JM73 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SrfQ9JM73 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SrfQ9JM73 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SrfQ9JM73 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SrfQ9JM73 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SrfQ9JM73 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SrfQ9JM73 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SrfQ9JM73 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SrfQ9JM73 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SrfQ9JM73 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SrfQ9JM73 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SrfQ9JM73 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SrfQ9JM73 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SrfQ9JM73 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SrfQ9JM73 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SrfQ9JM73 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SrfQ9JM73 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SrfQ9JM73 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SrfQ9JM73 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SrfQ9JM73 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SrfQ9JM73 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SrfQ9JM73 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SrfQ9JM73 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SrfQ9JM73 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SrfQ9JM73 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SrfQ9JM73 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SrfQ9JM73 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SrfQ9JM73 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SrfQ9JM73 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SrfQ9JM73 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SrfQ9JM73 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SrfQ9JM73 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SrfQ9JM73 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SrfQ9JM73 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SrfQ9JM73 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SrfQ9JM73 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SrfQ9JM73 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SrfQ9JM73 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SrfQ9JM73 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SrfQ9JM73 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SrfQ9JM73 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SrfQ9JM73 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SrfQ9JM73 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SrfQ9JM73 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SrfQ9JM73 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SrfQ9JM73 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SrfQ9JM73 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SrfQ9JM73 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SrfQ9JM73 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SrfQ9JM73 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SrfQ9JM73 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SrfQ9JM73 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SrfQ9JM73 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SrfQ9JM73 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SrfQ9JM73 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SrfQ9JM73 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SrfQ9JM73 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SrfQ9JM73 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SrfQ9JM73 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SrfQ9JM73 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SrfQ9JM73 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SrfQ9JM73 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SrfQ9JM73 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SrfQ9JM73 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SrfQ9JM73 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SrfQ9JM73 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SrfQ9JM73 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SrfQ9JM73 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SrfQ9JM73 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SrfQ9JM73 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SrfQ9JM73 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SrfQ9JM73 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SrfQ9JM73 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SrfQ9JM73 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SrfQ9JM73 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SrfQ9JM73 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SrfQ9JM73 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SrfQ9JM73 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SrfQ9JM73 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SrfQ9JM73 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SrfQ9JM73 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SrfQ9JM73 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SrfQ9JM73 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms