Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC8

Sacs, Sacsin, mousemouse

Predictions only

Length 4,582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SacsQ9JLC8 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SacsQ9JLC8 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
SacsQ9JLC8 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
SacsQ9JLC8 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SacsQ9JLC8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SacsQ9JLC8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SacsQ9JLC8 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SacsQ9JLC8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SacsQ9JLC8 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SacsQ9JLC8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SacsQ9JLC8 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SacsQ9JLC8 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SacsQ9JLC8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SacsQ9JLC8 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SacsQ9JLC8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SacsQ9JLC8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SacsQ9JLC8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SacsQ9JLC8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SacsQ9JLC8 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SacsQ9JLC8 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SacsQ9JLC8 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
SacsQ9JLC8 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SacsQ9JLC8 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SacsQ9JLC8 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SacsQ9JLC8 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SacsQ9JLC8 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SacsQ9JLC8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SacsQ9JLC8 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SacsQ9JLC8 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SacsQ9JLC8 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SacsQ9JLC8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC11□□□□□ -0.65
SacsQ9JLC8 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
SacsQ9JLC8 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SacsQ9JLC8 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
SacsQ9JLC8 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SacsQ9JLC8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
SacsQ9JLC8 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SacsQ9JLC8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SacsQ9JLC8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SacsQ9JLC8 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SacsQ9JLC8 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SacsQ9JLC8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SacsQ9JLC8 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SacsQ9JLC8 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SacsQ9JLC8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SacsQ9JLC8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SacsQ9JLC8 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
SacsQ9JLC8 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC11□□□□□ -0.65
SacsQ9JLC8 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SacsQ9JLC8 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SacsQ9JLC8 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SacsQ9JLC8 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SacsQ9JLC8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SacsQ9JLC8 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SacsQ9JLC8 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SacsQ9JLC8 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SacsQ9JLC8 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SacsQ9JLC8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SacsQ9JLC8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SacsQ9JLC8 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SacsQ9JLC8 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SacsQ9JLC8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SacsQ9JLC8 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SacsQ9JLC8 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SacsQ9JLC8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SacsQ9JLC8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SacsQ9JLC8 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SacsQ9JLC8 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SacsQ9JLC8 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SacsQ9JLC8 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SacsQ9JLC8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SacsQ9JLC8 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SacsQ9JLC8 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SacsQ9JLC8 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SacsQ9JLC8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SacsQ9JLC8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SacsQ9JLC8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SacsQ9JLC8 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SacsQ9JLC8 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SacsQ9JLC8 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SacsQ9JLC8 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SacsQ9JLC8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SacsQ9JLC8 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SacsQ9JLC8 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SacsQ9JLC8 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SacsQ9JLC8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SacsQ9JLC8 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SacsQ9JLC8 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SacsQ9JLC8 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SacsQ9JLC8 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SacsQ9JLC8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SacsQ9JLC8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SacsQ9JLC8 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
SacsQ9JLC8 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SacsQ9JLC8 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SacsQ9JLC8 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SacsQ9JLC8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SacsQ9JLC8 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SacsQ9JLC8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SacsQ9JLC8 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms