Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC6

Tef, Thyrotroph embryonic factor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefQ9JLC6 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TefQ9JLC6 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TefQ9JLC6 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TefQ9JLC6 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TefQ9JLC6 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TefQ9JLC6 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TefQ9JLC6 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TefQ9JLC6 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TefQ9JLC6 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TefQ9JLC6 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TefQ9JLC6 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TefQ9JLC6 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TefQ9JLC6 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TefQ9JLC6 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TefQ9JLC6 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TefQ9JLC6 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TefQ9JLC6 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TefQ9JLC6 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TefQ9JLC6 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TefQ9JLC6 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TefQ9JLC6 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TefQ9JLC6 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TefQ9JLC6 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TefQ9JLC6 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TefQ9JLC6 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TefQ9JLC6 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TefQ9JLC6 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TefQ9JLC6 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TefQ9JLC6 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TefQ9JLC6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TefQ9JLC6 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TefQ9JLC6 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TefQ9JLC6 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TefQ9JLC6 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TefQ9JLC6 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TefQ9JLC6 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TefQ9JLC6 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TefQ9JLC6 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TefQ9JLC6 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TefQ9JLC6 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TefQ9JLC6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TefQ9JLC6 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TefQ9JLC6 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TefQ9JLC6 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TefQ9JLC6 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TefQ9JLC6 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TefQ9JLC6 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TefQ9JLC6 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TefQ9JLC6 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TefQ9JLC6 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TefQ9JLC6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TefQ9JLC6 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TefQ9JLC6 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TefQ9JLC6 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TefQ9JLC6 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TefQ9JLC6 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TefQ9JLC6 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TefQ9JLC6 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TefQ9JLC6 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TefQ9JLC6 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TefQ9JLC6 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TefQ9JLC6 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TefQ9JLC6 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TefQ9JLC6 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TefQ9JLC6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TefQ9JLC6 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TefQ9JLC6 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TefQ9JLC6 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TefQ9JLC6 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TefQ9JLC6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TefQ9JLC6 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TefQ9JLC6 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TefQ9JLC6 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TefQ9JLC6 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TefQ9JLC6 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TefQ9JLC6 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TefQ9JLC6 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TefQ9JLC6 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TefQ9JLC6 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TefQ9JLC6 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TefQ9JLC6 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TefQ9JLC6 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TefQ9JLC6 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TefQ9JLC6 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TefQ9JLC6 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TefQ9JLC6 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TefQ9JLC6 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TefQ9JLC6 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TefQ9JLC6 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TefQ9JLC6 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TefQ9JLC6 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TefQ9JLC6 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TefQ9JLC6 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TefQ9JLC6 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TefQ9JLC6 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TefQ9JLC6 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TefQ9JLC6 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TefQ9JLC6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TefQ9JLC6 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TefQ9JLC6 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms