Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB4

Cubn, Cubilin, mousemouse

Predictions only

Length 3,623 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CubnQ9JLB4 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CubnQ9JLB4 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CubnQ9JLB4 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CubnQ9JLB4 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CubnQ9JLB4 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CubnQ9JLB4 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CubnQ9JLB4 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CubnQ9JLB4 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CubnQ9JLB4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CubnQ9JLB4 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CubnQ9JLB4 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CubnQ9JLB4 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CubnQ9JLB4 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CubnQ9JLB4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CubnQ9JLB4 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CubnQ9JLB4 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CubnQ9JLB4 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CubnQ9JLB4 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CubnQ9JLB4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CubnQ9JLB4 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CubnQ9JLB4 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CubnQ9JLB4 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms