Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS5

Habp4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Habp4Q9JKS5 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Habp4Q9JKS5 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Habp4Q9JKS5 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Habp4Q9JKS5 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Habp4Q9JKS5 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Habp4Q9JKS5 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Habp4Q9JKS5 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Habp4Q9JKS5 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Habp4Q9JKS5 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Habp4Q9JKS5 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Habp4Q9JKS5 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Habp4Q9JKS5 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Habp4Q9JKS5 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Habp4Q9JKS5 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Habp4Q9JKS5 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Habp4Q9JKS5 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Habp4Q9JKS5 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Habp4Q9JKS5 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Habp4Q9JKS5 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Habp4Q9JKS5 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Habp4Q9JKS5 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Habp4Q9JKS5 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Habp4Q9JKS5 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Habp4Q9JKS5 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Habp4Q9JKS5 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Habp4Q9JKS5 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Habp4Q9JKS5 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Habp4Q9JKS5 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Habp4Q9JKS5 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Habp4Q9JKS5 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Habp4Q9JKS5 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Habp4Q9JKS5 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Habp4Q9JKS5 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Habp4Q9JKS5 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Habp4Q9JKS5 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Habp4Q9JKS5 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Habp4Q9JKS5 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Habp4Q9JKS5 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Habp4Q9JKS5 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Habp4Q9JKS5 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Habp4Q9JKS5 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Habp4Q9JKS5 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Habp4Q9JKS5 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Habp4Q9JKS5 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Habp4Q9JKS5 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Habp4Q9JKS5 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Habp4Q9JKS5 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Habp4Q9JKS5 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Habp4Q9JKS5 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Habp4Q9JKS5 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Habp4Q9JKS5 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Habp4Q9JKS5 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Habp4Q9JKS5 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Habp4Q9JKS5 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Habp4Q9JKS5 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Habp4Q9JKS5 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Habp4Q9JKS5 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Habp4Q9JKS5 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Habp4Q9JKS5 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Habp4Q9JKS5 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Habp4Q9JKS5 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Habp4Q9JKS5 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Habp4Q9JKS5 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Habp4Q9JKS5 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Habp4Q9JKS5 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Habp4Q9JKS5 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Habp4Q9JKS5 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Habp4Q9JKS5 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Habp4Q9JKS5 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Habp4Q9JKS5 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Habp4Q9JKS5 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Habp4Q9JKS5 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Habp4Q9JKS5 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Habp4Q9JKS5 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Habp4Q9JKS5 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Habp4Q9JKS5 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Habp4Q9JKS5 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Habp4Q9JKS5 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Habp4Q9JKS5 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Habp4Q9JKS5 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Habp4Q9JKS5 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Habp4Q9JKS5 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Habp4Q9JKS5 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Habp4Q9JKS5 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Habp4Q9JKS5 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Habp4Q9JKS5 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Habp4Q9JKS5 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Habp4Q9JKS5 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Habp4Q9JKS5 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Habp4Q9JKS5 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Habp4Q9JKS5 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Habp4Q9JKS5 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Habp4Q9JKS5 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Habp4Q9JKS5 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Habp4Q9JKS5 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Habp4Q9JKS5 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Habp4Q9JKS5 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Habp4Q9JKS5 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Habp4Q9JKS5 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Habp4Q9JKS5 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms