Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ldb3Q9JKS4 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ldb3Q9JKS4 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ldb3Q9JKS4 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ldb3Q9JKS4 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ldb3Q9JKS4 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ldb3Q9JKS4 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ldb3Q9JKS4 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ldb3Q9JKS4 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ldb3Q9JKS4 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ldb3Q9JKS4 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ldb3Q9JKS4 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ldb3Q9JKS4 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ldb3Q9JKS4 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ldb3Q9JKS4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ldb3Q9JKS4 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ldb3Q9JKS4 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ldb3Q9JKS4 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ldb3Q9JKS4 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ldb3Q9JKS4 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ldb3Q9JKS4 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ldb3Q9JKS4 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ldb3Q9JKS4 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ldb3Q9JKS4 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ldb3Q9JKS4 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ldb3Q9JKS4 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ldb3Q9JKS4 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ldb3Q9JKS4 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ldb3Q9JKS4 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ldb3Q9JKS4 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ldb3Q9JKS4 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ldb3Q9JKS4 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ldb3Q9JKS4 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ldb3Q9JKS4 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ldb3Q9JKS4 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ldb3Q9JKS4 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ldb3Q9JKS4 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ldb3Q9JKS4 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ldb3Q9JKS4 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ldb3Q9JKS4 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ldb3Q9JKS4 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ldb3Q9JKS4 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ldb3Q9JKS4 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ldb3Q9JKS4 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ldb3Q9JKS4 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ldb3Q9JKS4 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ldb3Q9JKS4 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ldb3Q9JKS4 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ldb3Q9JKS4 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ldb3Q9JKS4 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ldb3Q9JKS4 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ldb3Q9JKS4 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ldb3Q9JKS4 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ldb3Q9JKS4 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ldb3Q9JKS4 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ldb3Q9JKS4 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ldb3Q9JKS4 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ldb3Q9JKS4 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ldb3Q9JKS4 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ldb3Q9JKS4 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ldb3Q9JKS4 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ldb3Q9JKS4 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ldb3Q9JKS4 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ldb3Q9JKS4 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ldb3Q9JKS4 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ldb3Q9JKS4 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ldb3Q9JKS4 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ldb3Q9JKS4 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ldb3Q9JKS4 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ldb3Q9JKS4 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ldb3Q9JKS4 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ldb3Q9JKS4 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ldb3Q9JKS4 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ldb3Q9JKS4 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ldb3Q9JKS4 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ldb3Q9JKS4 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ldb3Q9JKS4 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ldb3Q9JKS4 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ldb3Q9JKS4 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ldb3Q9JKS4 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ldb3Q9JKS4 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ldb3Q9JKS4 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ldb3Q9JKS4 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ldb3Q9JKS4 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ldb3Q9JKS4 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ldb3Q9JKS4 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ldb3Q9JKS4 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ldb3Q9JKS4 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms