Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Irx5Q9JKQ4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Irx5Q9JKQ4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Irx5Q9JKQ4 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Irx5Q9JKQ4 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Irx5Q9JKQ4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Irx5Q9JKQ4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Irx5Q9JKQ4 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Irx5Q9JKQ4 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Irx5Q9JKQ4 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Irx5Q9JKQ4 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Irx5Q9JKQ4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Irx5Q9JKQ4 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Irx5Q9JKQ4 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Irx5Q9JKQ4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Irx5Q9JKQ4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Irx5Q9JKQ4 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Irx5Q9JKQ4 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Irx5Q9JKQ4 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Irx5Q9JKQ4 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Irx5Q9JKQ4 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Irx5Q9JKQ4 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Irx5Q9JKQ4 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Irx5Q9JKQ4 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Irx5Q9JKQ4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Irx5Q9JKQ4 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Irx5Q9JKQ4 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Irx5Q9JKQ4 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Irx5Q9JKQ4 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Irx5Q9JKQ4 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Irx5Q9JKQ4 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Irx5Q9JKQ4 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Irx5Q9JKQ4 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Irx5Q9JKQ4 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Irx5Q9JKQ4 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Irx5Q9JKQ4 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Irx5Q9JKQ4 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Irx5Q9JKQ4 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Irx5Q9JKQ4 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Irx5Q9JKQ4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Irx5Q9JKQ4 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Irx5Q9JKQ4 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Irx5Q9JKQ4 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Irx5Q9JKQ4 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Irx5Q9JKQ4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Irx5Q9JKQ4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Irx5Q9JKQ4 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Irx5Q9JKQ4 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Irx5Q9JKQ4 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Irx5Q9JKQ4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Irx5Q9JKQ4 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Irx5Q9JKQ4 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Irx5Q9JKQ4 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Irx5Q9JKQ4 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Irx5Q9JKQ4 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Irx5Q9JKQ4 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Irx5Q9JKQ4 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Irx5Q9JKQ4 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Irx5Q9JKQ4 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Irx5Q9JKQ4 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Irx5Q9JKQ4 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Irx5Q9JKQ4 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Irx5Q9JKQ4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Irx5Q9JKQ4 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Irx5Q9JKQ4 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Irx5Q9JKQ4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Irx5Q9JKQ4 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Irx5Q9JKQ4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Irx5Q9JKQ4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Irx5Q9JKQ4 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Irx5Q9JKQ4 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Irx5Q9JKQ4 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Irx5Q9JKQ4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Irx5Q9JKQ4 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Irx5Q9JKQ4 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Irx5Q9JKQ4 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Irx5Q9JKQ4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Irx5Q9JKQ4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Irx5Q9JKQ4 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Irx5Q9JKQ4 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Irx5Q9JKQ4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Irx5Q9JKQ4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Irx5Q9JKQ4 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Irx5Q9JKQ4 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Irx5Q9JKQ4 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Irx5Q9JKQ4 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Irx5Q9JKQ4 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Irx5Q9JKQ4 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Irx5Q9JKQ4 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Irx5Q9JKQ4 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Irx5Q9JKQ4 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Irx5Q9JKQ4 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Irx5Q9JKQ4 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Irx5Q9JKQ4 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Irx5Q9JKQ4 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Irx5Q9JKQ4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Irx5Q9JKQ4 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Irx5Q9JKQ4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Irx5Q9JKQ4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Irx5Q9JKQ4 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms