Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chrac1Q9JKP8 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chrac1Q9JKP8 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chrac1Q9JKP8 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chrac1Q9JKP8 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chrac1Q9JKP8 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chrac1Q9JKP8 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chrac1Q9JKP8 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chrac1Q9JKP8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chrac1Q9JKP8 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chrac1Q9JKP8 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chrac1Q9JKP8 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chrac1Q9JKP8 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chrac1Q9JKP8 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chrac1Q9JKP8 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chrac1Q9JKP8 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chrac1Q9JKP8 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chrac1Q9JKP8 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Chrac1Q9JKP8 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chrac1Q9JKP8 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chrac1Q9JKP8 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chrac1Q9JKP8 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chrac1Q9JKP8 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chrac1Q9JKP8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chrac1Q9JKP8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chrac1Q9JKP8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chrac1Q9JKP8 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chrac1Q9JKP8 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chrac1Q9JKP8 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chrac1Q9JKP8 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chrac1Q9JKP8 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chrac1Q9JKP8 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chrac1Q9JKP8 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chrac1Q9JKP8 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Chrac1Q9JKP8 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Chrac1Q9JKP8 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Chrac1Q9JKP8 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Chrac1Q9JKP8 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Chrac1Q9JKP8 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Chrac1Q9JKP8 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Chrac1Q9JKP8 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Chrac1Q9JKP8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Chrac1Q9JKP8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Chrac1Q9JKP8 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Chrac1Q9JKP8 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Chrac1Q9JKP8 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Chrac1Q9JKP8 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Chrac1Q9JKP8 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Chrac1Q9JKP8 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Chrac1Q9JKP8 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Chrac1Q9JKP8 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Chrac1Q9JKP8 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Chrac1Q9JKP8 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Chrac1Q9JKP8 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Chrac1Q9JKP8 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Chrac1Q9JKP8 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Chrac1Q9JKP8 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Chrac1Q9JKP8 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Chrac1Q9JKP8 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Chrac1Q9JKP8 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Chrac1Q9JKP8 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Chrac1Q9JKP8 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Chrac1Q9JKP8 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Chrac1Q9JKP8 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Chrac1Q9JKP8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Chrac1Q9JKP8 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Chrac1Q9JKP8 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Chrac1Q9JKP8 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Chrac1Q9JKP8 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Chrac1Q9JKP8 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Chrac1Q9JKP8 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Chrac1Q9JKP8 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Chrac1Q9JKP8 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chrac1Q9JKP8 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chrac1Q9JKP8 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chrac1Q9JKP8 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chrac1Q9JKP8 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chrac1Q9JKP8 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chrac1Q9JKP8 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chrac1Q9JKP8 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chrac1Q9JKP8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chrac1Q9JKP8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chrac1Q9JKP8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chrac1Q9JKP8 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chrac1Q9JKP8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Chrac1Q9JKP8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chrac1Q9JKP8 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chrac1Q9JKP8 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chrac1Q9JKP8 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chrac1Q9JKP8 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chrac1Q9JKP8 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chrac1Q9JKP8 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chrac1Q9JKP8 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chrac1Q9JKP8 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chrac1Q9JKP8 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chrac1Q9JKP8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chrac1Q9JKP8 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chrac1Q9JKP8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chrac1Q9JKP8 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chrac1Q9JKP8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms