Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP7

Pole3, DNA polymerase epsilon subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole3Q9JKP7 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pole3Q9JKP7 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pole3Q9JKP7 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pole3Q9JKP7 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pole3Q9JKP7 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pole3Q9JKP7 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pole3Q9JKP7 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pole3Q9JKP7 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pole3Q9JKP7 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pole3Q9JKP7 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Pole3Q9JKP7 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pole3Q9JKP7 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pole3Q9JKP7 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pole3Q9JKP7 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pole3Q9JKP7 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pole3Q9JKP7 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pole3Q9JKP7 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Pole3Q9JKP7 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pole3Q9JKP7 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pole3Q9JKP7 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pole3Q9JKP7 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pole3Q9JKP7 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pole3Q9JKP7 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pole3Q9JKP7 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pole3Q9JKP7 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pole3Q9JKP7 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Pole3Q9JKP7 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pole3Q9JKP7 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pole3Q9JKP7 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pole3Q9JKP7 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pole3Q9JKP7 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pole3Q9JKP7 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pole3Q9JKP7 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pole3Q9JKP7 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pole3Q9JKP7 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pole3Q9JKP7 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pole3Q9JKP7 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pole3Q9JKP7 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pole3Q9JKP7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pole3Q9JKP7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pole3Q9JKP7 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pole3Q9JKP7 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pole3Q9JKP7 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pole3Q9JKP7 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Pole3Q9JKP7 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pole3Q9JKP7 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pole3Q9JKP7 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pole3Q9JKP7 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pole3Q9JKP7 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pole3Q9JKP7 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pole3Q9JKP7 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pole3Q9JKP7 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Pole3Q9JKP7 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pole3Q9JKP7 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Pole3Q9JKP7 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pole3Q9JKP7 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pole3Q9JKP7 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pole3Q9JKP7 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pole3Q9JKP7 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pole3Q9JKP7 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Pole3Q9JKP7 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pole3Q9JKP7 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pole3Q9JKP7 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pole3Q9JKP7 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pole3Q9JKP7 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pole3Q9JKP7 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pole3Q9JKP7 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pole3Q9JKP7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pole3Q9JKP7 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pole3Q9JKP7 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pole3Q9JKP7 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pole3Q9JKP7 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pole3Q9JKP7 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pole3Q9JKP7 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pole3Q9JKP7 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pole3Q9JKP7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pole3Q9JKP7 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pole3Q9JKP7 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pole3Q9JKP7 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pole3Q9JKP7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pole3Q9JKP7 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pole3Q9JKP7 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pole3Q9JKP7 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pole3Q9JKP7 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pole3Q9JKP7 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pole3Q9JKP7 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pole3Q9JKP7 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pole3Q9JKP7 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pole3Q9JKP7 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pole3Q9JKP7 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pole3Q9JKP7 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pole3Q9JKP7 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pole3Q9JKP7 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pole3Q9JKP7 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pole3Q9JKP7 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pole3Q9JKP7 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pole3Q9JKP7 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pole3Q9JKP7 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pole3Q9JKP7 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Pole3Q9JKP7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms