Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK8

Atr, Serine/threonine-protein kinase ATR, mousemouse

Predictions only

Length 2,635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrQ9JKK8 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
AtrQ9JKK8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
AtrQ9JKK8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
AtrQ9JKK8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
AtrQ9JKK8 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
AtrQ9JKK8 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
AtrQ9JKK8 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
AtrQ9JKK8 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
AtrQ9JKK8 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
AtrQ9JKK8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AtrQ9JKK8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
AtrQ9JKK8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AtrQ9JKK8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
AtrQ9JKK8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AtrQ9JKK8 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
AtrQ9JKK8 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AtrQ9JKK8 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AtrQ9JKK8 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AtrQ9JKK8 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
AtrQ9JKK8 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
AtrQ9JKK8 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
AtrQ9JKK8 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AtrQ9JKK8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AtrQ9JKK8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
AtrQ9JKK8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
AtrQ9JKK8 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AtrQ9JKK8 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AtrQ9JKK8 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AtrQ9JKK8 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AtrQ9JKK8 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
AtrQ9JKK8 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
AtrQ9JKK8 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
AtrQ9JKK8 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AtrQ9JKK8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AtrQ9JKK8 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AtrQ9JKK8 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AtrQ9JKK8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AtrQ9JKK8 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AtrQ9JKK8 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AtrQ9JKK8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AtrQ9JKK8 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
AtrQ9JKK8 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AtrQ9JKK8 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
AtrQ9JKK8 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
AtrQ9JKK8 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AtrQ9JKK8 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
AtrQ9JKK8 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AtrQ9JKK8 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AtrQ9JKK8 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
AtrQ9JKK8 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
AtrQ9JKK8 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AtrQ9JKK8 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
AtrQ9JKK8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
AtrQ9JKK8 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AtrQ9JKK8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
AtrQ9JKK8 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AtrQ9JKK8 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AtrQ9JKK8 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
AtrQ9JKK8 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
AtrQ9JKK8 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
AtrQ9JKK8 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
AtrQ9JKK8 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AtrQ9JKK8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
AtrQ9JKK8 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AtrQ9JKK8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AtrQ9JKK8 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AtrQ9JKK8 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
AtrQ9JKK8 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
AtrQ9JKK8 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
AtrQ9JKK8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AtrQ9JKK8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AtrQ9JKK8 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AtrQ9JKK8 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AtrQ9JKK8 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AtrQ9JKK8 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AtrQ9JKK8 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AtrQ9JKK8 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AtrQ9JKK8 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AtrQ9JKK8 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AtrQ9JKK8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AtrQ9JKK8 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AtrQ9JKK8 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AtrQ9JKK8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AtrQ9JKK8 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AtrQ9JKK8 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AtrQ9JKK8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AtrQ9JKK8 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AtrQ9JKK8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AtrQ9JKK8 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AtrQ9JKK8 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AtrQ9JKK8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AtrQ9JKK8 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AtrQ9JKK8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AtrQ9JKK8 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AtrQ9JKK8 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
AtrQ9JKK8 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AtrQ9JKK8 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AtrQ9JKK8 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AtrQ9JKK8 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AtrQ9JKK8 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms