Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC8

Ap3m1, AP-3 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3m1Q9JKC8 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ap3m1Q9JKC8 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ap3m1Q9JKC8 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ap3m1Q9JKC8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ap3m1Q9JKC8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ap3m1Q9JKC8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ap3m1Q9JKC8 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ap3m1Q9JKC8 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ap3m1Q9JKC8 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ap3m1Q9JKC8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ap3m1Q9JKC8 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ap3m1Q9JKC8 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ap3m1Q9JKC8 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ap3m1Q9JKC8 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ap3m1Q9JKC8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ap3m1Q9JKC8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ap3m1Q9JKC8 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ap3m1Q9JKC8 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ap3m1Q9JKC8 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ap3m1Q9JKC8 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ap3m1Q9JKC8 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ap3m1Q9JKC8 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ap3m1Q9JKC8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ap3m1Q9JKC8 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ap3m1Q9JKC8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ap3m1Q9JKC8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ap3m1Q9JKC8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ap3m1Q9JKC8 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ap3m1Q9JKC8 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ap3m1Q9JKC8 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ap3m1Q9JKC8 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ap3m1Q9JKC8 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ap3m1Q9JKC8 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ap3m1Q9JKC8 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ap3m1Q9JKC8 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ap3m1Q9JKC8 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ap3m1Q9JKC8 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ap3m1Q9JKC8 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ap3m1Q9JKC8 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ap3m1Q9JKC8 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ap3m1Q9JKC8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ap3m1Q9JKC8 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ap3m1Q9JKC8 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ap3m1Q9JKC8 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ap3m1Q9JKC8 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ap3m1Q9JKC8 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ap3m1Q9JKC8 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ap3m1Q9JKC8 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ap3m1Q9JKC8 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ap3m1Q9JKC8 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ap3m1Q9JKC8 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ap3m1Q9JKC8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ap3m1Q9JKC8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ap3m1Q9JKC8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ap3m1Q9JKC8 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ap3m1Q9JKC8 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ap3m1Q9JKC8 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ap3m1Q9JKC8 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ap3m1Q9JKC8 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ap3m1Q9JKC8 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ap3m1Q9JKC8 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ap3m1Q9JKC8 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ap3m1Q9JKC8 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ap3m1Q9JKC8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ap3m1Q9JKC8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ap3m1Q9JKC8 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ap3m1Q9JKC8 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ap3m1Q9JKC8 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ap3m1Q9JKC8 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ap3m1Q9JKC8 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ap3m1Q9JKC8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ap3m1Q9JKC8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ap3m1Q9JKC8 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ap3m1Q9JKC8 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ap3m1Q9JKC8 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ap3m1Q9JKC8 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ap3m1Q9JKC8 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ap3m1Q9JKC8 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ap3m1Q9JKC8 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ap3m1Q9JKC8 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ap3m1Q9JKC8 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ap3m1Q9JKC8 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ap3m1Q9JKC8 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ap3m1Q9JKC8 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ap3m1Q9JKC8 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ap3m1Q9JKC8 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ap3m1Q9JKC8 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ap3m1Q9JKC8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ap3m1Q9JKC8 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ap3m1Q9JKC8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ap3m1Q9JKC8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ap3m1Q9JKC8 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ap3m1Q9JKC8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ap3m1Q9JKC8 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ap3m1Q9JKC8 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ap3m1Q9JKC8 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ap3m1Q9JKC8 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ap3m1Q9JKC8 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms