Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ybx3Q9JKB3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ybx3Q9JKB3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ybx3Q9JKB3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ybx3Q9JKB3 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ybx3Q9JKB3 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ybx3Q9JKB3 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ybx3Q9JKB3 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ybx3Q9JKB3 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ybx3Q9JKB3 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ybx3Q9JKB3 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ybx3Q9JKB3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ybx3Q9JKB3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ybx3Q9JKB3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ybx3Q9JKB3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ybx3Q9JKB3 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ybx3Q9JKB3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ybx3Q9JKB3 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ybx3Q9JKB3 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ybx3Q9JKB3 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ybx3Q9JKB3 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ybx3Q9JKB3 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ybx3Q9JKB3 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ybx3Q9JKB3 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ybx3Q9JKB3 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ybx3Q9JKB3 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ybx3Q9JKB3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ybx3Q9JKB3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ybx3Q9JKB3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ybx3Q9JKB3 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ybx3Q9JKB3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ybx3Q9JKB3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ybx3Q9JKB3 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ybx3Q9JKB3 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ybx3Q9JKB3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ybx3Q9JKB3 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ybx3Q9JKB3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ybx3Q9JKB3 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ybx3Q9JKB3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ybx3Q9JKB3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ybx3Q9JKB3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ybx3Q9JKB3 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ybx3Q9JKB3 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ybx3Q9JKB3 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ybx3Q9JKB3 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ybx3Q9JKB3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ybx3Q9JKB3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ybx3Q9JKB3 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ybx3Q9JKB3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ybx3Q9JKB3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ybx3Q9JKB3 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ybx3Q9JKB3 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ybx3Q9JKB3 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ybx3Q9JKB3 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ybx3Q9JKB3 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ybx3Q9JKB3 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ybx3Q9JKB3 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ybx3Q9JKB3 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ybx3Q9JKB3 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ybx3Q9JKB3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ybx3Q9JKB3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ybx3Q9JKB3 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ybx3Q9JKB3 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ybx3Q9JKB3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ybx3Q9JKB3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ybx3Q9JKB3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ybx3Q9JKB3 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ybx3Q9JKB3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ybx3Q9JKB3 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ybx3Q9JKB3 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ybx3Q9JKB3 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ybx3Q9JKB3 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ybx3Q9JKB3 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ybx3Q9JKB3 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ybx3Q9JKB3 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ybx3Q9JKB3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ybx3Q9JKB3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ybx3Q9JKB3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ybx3Q9JKB3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ybx3Q9JKB3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ybx3Q9JKB3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ybx3Q9JKB3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ybx3Q9JKB3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ybx3Q9JKB3 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ybx3Q9JKB3 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ybx3Q9JKB3 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ybx3Q9JKB3 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ybx3Q9JKB3 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ybx3Q9JKB3 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ybx3Q9JKB3 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ybx3Q9JKB3 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ybx3Q9JKB3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ybx3Q9JKB3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ybx3Q9JKB3 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ybx3Q9JKB3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ybx3Q9JKB3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ybx3Q9JKB3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ybx3Q9JKB3 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ybx3Q9JKB3 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ybx3Q9JKB3 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms