Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY4

Ddx20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx20Q9JJY4 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ddx20Q9JJY4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ddx20Q9JJY4 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ddx20Q9JJY4 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ddx20Q9JJY4 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ddx20Q9JJY4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ddx20Q9JJY4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ddx20Q9JJY4 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ddx20Q9JJY4 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ddx20Q9JJY4 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ddx20Q9JJY4 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ddx20Q9JJY4 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ddx20Q9JJY4 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ddx20Q9JJY4 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ddx20Q9JJY4 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ddx20Q9JJY4 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ddx20Q9JJY4 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ddx20Q9JJY4 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ddx20Q9JJY4 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ddx20Q9JJY4 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ddx20Q9JJY4 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ddx20Q9JJY4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ddx20Q9JJY4 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ddx20Q9JJY4 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ddx20Q9JJY4 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ddx20Q9JJY4 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ddx20Q9JJY4 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ddx20Q9JJY4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ddx20Q9JJY4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ddx20Q9JJY4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ddx20Q9JJY4 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ddx20Q9JJY4 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ddx20Q9JJY4 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ddx20Q9JJY4 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ddx20Q9JJY4 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ddx20Q9JJY4 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ddx20Q9JJY4 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ddx20Q9JJY4 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ddx20Q9JJY4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ddx20Q9JJY4 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ddx20Q9JJY4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ddx20Q9JJY4 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ddx20Q9JJY4 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ddx20Q9JJY4 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ddx20Q9JJY4 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ddx20Q9JJY4 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ddx20Q9JJY4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ddx20Q9JJY4 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ddx20Q9JJY4 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ddx20Q9JJY4 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ddx20Q9JJY4 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ddx20Q9JJY4 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ddx20Q9JJY4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ddx20Q9JJY4 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ddx20Q9JJY4 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ddx20Q9JJY4 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ddx20Q9JJY4 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ddx20Q9JJY4 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ddx20Q9JJY4 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ddx20Q9JJY4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ddx20Q9JJY4 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ddx20Q9JJY4 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ddx20Q9JJY4 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ddx20Q9JJY4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ddx20Q9JJY4 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ddx20Q9JJY4 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ddx20Q9JJY4 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ddx20Q9JJY4 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ddx20Q9JJY4 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ddx20Q9JJY4 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ddx20Q9JJY4 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ddx20Q9JJY4 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ddx20Q9JJY4 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ddx20Q9JJY4 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ddx20Q9JJY4 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ddx20Q9JJY4 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ddx20Q9JJY4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ddx20Q9JJY4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ddx20Q9JJY4 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ddx20Q9JJY4 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ddx20Q9JJY4 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ddx20Q9JJY4 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ddx20Q9JJY4 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ddx20Q9JJY4 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ddx20Q9JJY4 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ddx20Q9JJY4 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ddx20Q9JJY4 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ddx20Q9JJY4 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ddx20Q9JJY4 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ddx20Q9JJY4 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ddx20Q9JJY4 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ddx20Q9JJY4 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ddx20Q9JJY4 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ddx20Q9JJY4 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ddx20Q9JJY4 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ddx20Q9JJY4 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ddx20Q9JJY4 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ddx20Q9JJY4 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ddx20Q9JJY4 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ddx20Q9JJY4 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms