Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS6

Bco1, Beta,beta-carotene 15,15'-dioxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco1Q9JJS6 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Bco1Q9JJS6 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Bco1Q9JJS6 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Bco1Q9JJS6 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Bco1Q9JJS6 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bco1Q9JJS6 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
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Bco1Q9JJS6 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Bco1Q9JJS6 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bco1Q9JJS6 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bco1Q9JJS6 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bco1Q9JJS6 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Bco1Q9JJS6 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bco1Q9JJS6 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bco1Q9JJS6 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bco1Q9JJS6 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Bco1Q9JJS6 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bco1Q9JJS6 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bco1Q9JJS6 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Bco1Q9JJS6 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bco1Q9JJS6 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bco1Q9JJS6 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bco1Q9JJS6 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bco1Q9JJS6 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bco1Q9JJS6 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bco1Q9JJS6 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Bco1Q9JJS6 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bco1Q9JJS6 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bco1Q9JJS6 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Bco1Q9JJS6 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bco1Q9JJS6 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Bco1Q9JJS6 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bco1Q9JJS6 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bco1Q9JJS6 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bco1Q9JJS6 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
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Bco1Q9JJS6 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Bco1Q9JJS6 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Bco1Q9JJS6 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bco1Q9JJS6 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Bco1Q9JJS6 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bco1Q9JJS6 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bco1Q9JJS6 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bco1Q9JJS6 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Bco1Q9JJS6 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bco1Q9JJS6 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bco1Q9JJS6 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bco1Q9JJS6 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bco1Q9JJS6 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bco1Q9JJS6 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bco1Q9JJS6 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bco1Q9JJS6 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bco1Q9JJS6 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bco1Q9JJS6 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Bco1Q9JJS6 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bco1Q9JJS6 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bco1Q9JJS6 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bco1Q9JJS6 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bco1Q9JJS6 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bco1Q9JJS6 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bco1Q9JJS6 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bco1Q9JJS6 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Bco1Q9JJS6 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
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