Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN2

Zfhx4, Zinc finger homeobox protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 3,550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfhx4Q9JJN2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfhx4Q9JJN2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfhx4Q9JJN2 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfhx4Q9JJN2 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfhx4Q9JJN2 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfhx4Q9JJN2 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfhx4Q9JJN2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfhx4Q9JJN2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfhx4Q9JJN2 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfhx4Q9JJN2 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfhx4Q9JJN2 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfhx4Q9JJN2 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfhx4Q9JJN2 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfhx4Q9JJN2 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfhx4Q9JJN2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfhx4Q9JJN2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfhx4Q9JJN2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfhx4Q9JJN2 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfhx4Q9JJN2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfhx4Q9JJN2 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfhx4Q9JJN2 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfhx4Q9JJN2 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfhx4Q9JJN2 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfhx4Q9JJN2 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfhx4Q9JJN2 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfhx4Q9JJN2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfhx4Q9JJN2 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfhx4Q9JJN2 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfhx4Q9JJN2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfhx4Q9JJN2 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfhx4Q9JJN2 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfhx4Q9JJN2 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfhx4Q9JJN2 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfhx4Q9JJN2 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfhx4Q9JJN2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfhx4Q9JJN2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfhx4Q9JJN2 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfhx4Q9JJN2 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfhx4Q9JJN2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfhx4Q9JJN2 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfhx4Q9JJN2 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfhx4Q9JJN2 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfhx4Q9JJN2 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfhx4Q9JJN2 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfhx4Q9JJN2 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfhx4Q9JJN2 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfhx4Q9JJN2 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfhx4Q9JJN2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfhx4Q9JJN2 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfhx4Q9JJN2 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfhx4Q9JJN2 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfhx4Q9JJN2 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfhx4Q9JJN2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfhx4Q9JJN2 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfhx4Q9JJN2 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfhx4Q9JJN2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfhx4Q9JJN2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfhx4Q9JJN2 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfhx4Q9JJN2 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfhx4Q9JJN2 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfhx4Q9JJN2 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms