Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ89

Ccdc86, Coiled-coil domain-containing protein 86, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc86Q9JJ89 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc86Q9JJ89 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc86Q9JJ89 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc86Q9JJ89 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc86Q9JJ89 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc86Q9JJ89 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc86Q9JJ89 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc86Q9JJ89 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc86Q9JJ89 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc86Q9JJ89 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc86Q9JJ89 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc86Q9JJ89 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc86Q9JJ89 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc86Q9JJ89 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc86Q9JJ89 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc86Q9JJ89 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc86Q9JJ89 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc86Q9JJ89 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc86Q9JJ89 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc86Q9JJ89 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc86Q9JJ89 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc86Q9JJ89 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc86Q9JJ89 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc86Q9JJ89 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc86Q9JJ89 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc86Q9JJ89 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc86Q9JJ89 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc86Q9JJ89 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc86Q9JJ89 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc86Q9JJ89 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc86Q9JJ89 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc86Q9JJ89 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc86Q9JJ89 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc86Q9JJ89 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc86Q9JJ89 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc86Q9JJ89 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc86Q9JJ89 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc86Q9JJ89 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc86Q9JJ89 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc86Q9JJ89 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc86Q9JJ89 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc86Q9JJ89 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc86Q9JJ89 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc86Q9JJ89 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc86Q9JJ89 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc86Q9JJ89 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc86Q9JJ89 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc86Q9JJ89 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc86Q9JJ89 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc86Q9JJ89 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc86Q9JJ89 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc86Q9JJ89 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc86Q9JJ89 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc86Q9JJ89 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc86Q9JJ89 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc86Q9JJ89 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc86Q9JJ89 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc86Q9JJ89 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc86Q9JJ89 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc86Q9JJ89 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc86Q9JJ89 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc86Q9JJ89 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc86Q9JJ89 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc86Q9JJ89 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc86Q9JJ89 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc86Q9JJ89 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc86Q9JJ89 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc86Q9JJ89 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc86Q9JJ89 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc86Q9JJ89 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc86Q9JJ89 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc86Q9JJ89 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc86Q9JJ89 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc86Q9JJ89 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc86Q9JJ89 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc86Q9JJ89 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc86Q9JJ89 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc86Q9JJ89 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc86Q9JJ89 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc86Q9JJ89 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc86Q9JJ89 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc86Q9JJ89 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc86Q9JJ89 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc86Q9JJ89 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc86Q9JJ89 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc86Q9JJ89 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc86Q9JJ89 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc86Q9JJ89 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc86Q9JJ89 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc86Q9JJ89 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc86Q9JJ89 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc86Q9JJ89 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc86Q9JJ89 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc86Q9JJ89 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc86Q9JJ89 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc86Q9JJ89 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc86Q9JJ89 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc86Q9JJ89 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc86Q9JJ89 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc86Q9JJ89 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms