Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ57

Kcnip1, Kv channel-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip1Q9JJ57 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnip1Q9JJ57 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnip1Q9JJ57 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnip1Q9JJ57 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnip1Q9JJ57 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnip1Q9JJ57 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnip1Q9JJ57 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnip1Q9JJ57 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnip1Q9JJ57 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnip1Q9JJ57 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnip1Q9JJ57 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnip1Q9JJ57 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnip1Q9JJ57 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnip1Q9JJ57 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnip1Q9JJ57 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnip1Q9JJ57 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnip1Q9JJ57 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnip1Q9JJ57 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnip1Q9JJ57 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnip1Q9JJ57 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnip1Q9JJ57 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnip1Q9JJ57 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnip1Q9JJ57 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnip1Q9JJ57 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnip1Q9JJ57 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnip1Q9JJ57 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnip1Q9JJ57 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnip1Q9JJ57 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnip1Q9JJ57 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnip1Q9JJ57 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnip1Q9JJ57 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnip1Q9JJ57 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnip1Q9JJ57 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnip1Q9JJ57 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnip1Q9JJ57 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnip1Q9JJ57 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnip1Q9JJ57 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnip1Q9JJ57 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnip1Q9JJ57 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnip1Q9JJ57 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnip1Q9JJ57 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnip1Q9JJ57 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnip1Q9JJ57 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnip1Q9JJ57 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnip1Q9JJ57 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Kcnip1Q9JJ57 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnip1Q9JJ57 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnip1Q9JJ57 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnip1Q9JJ57 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnip1Q9JJ57 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnip1Q9JJ57 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnip1Q9JJ57 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnip1Q9JJ57 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnip1Q9JJ57 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnip1Q9JJ57 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnip1Q9JJ57 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnip1Q9JJ57 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnip1Q9JJ57 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnip1Q9JJ57 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnip1Q9JJ57 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnip1Q9JJ57 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnip1Q9JJ57 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnip1Q9JJ57 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnip1Q9JJ57 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Kcnip1Q9JJ57 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnip1Q9JJ57 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnip1Q9JJ57 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnip1Q9JJ57 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnip1Q9JJ57 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnip1Q9JJ57 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnip1Q9JJ57 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnip1Q9JJ57 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnip1Q9JJ57 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnip1Q9JJ57 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnip1Q9JJ57 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnip1Q9JJ57 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnip1Q9JJ57 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnip1Q9JJ57 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnip1Q9JJ57 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnip1Q9JJ57 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnip1Q9JJ57 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnip1Q9JJ57 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnip1Q9JJ57 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnip1Q9JJ57 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnip1Q9JJ57 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnip1Q9JJ57 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
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Kcnip1Q9JJ57 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Kcnip1Q9JJ57 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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