Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS8

Slc12a4, Solute carrier family 12 member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a4Q9JIS8 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc12a4Q9JIS8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc12a4Q9JIS8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc12a4Q9JIS8 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc12a4Q9JIS8 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc12a4Q9JIS8 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc12a4Q9JIS8 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc12a4Q9JIS8 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc12a4Q9JIS8 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc12a4Q9JIS8 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc12a4Q9JIS8 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc12a4Q9JIS8 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc12a4Q9JIS8 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc12a4Q9JIS8 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc12a4Q9JIS8 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc12a4Q9JIS8 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc12a4Q9JIS8 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc12a4Q9JIS8 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc12a4Q9JIS8 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc12a4Q9JIS8 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc12a4Q9JIS8 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc12a4Q9JIS8 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc12a4Q9JIS8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc12a4Q9JIS8 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc12a4Q9JIS8 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc12a4Q9JIS8 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc12a4Q9JIS8 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc12a4Q9JIS8 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc12a4Q9JIS8 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc12a4Q9JIS8 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc12a4Q9JIS8 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc12a4Q9JIS8 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slc12a4Q9JIS8 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slc12a4Q9JIS8 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc12a4Q9JIS8 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc12a4Q9JIS8 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc12a4Q9JIS8 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc12a4Q9JIS8 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc12a4Q9JIS8 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc12a4Q9JIS8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc12a4Q9JIS8 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc12a4Q9JIS8 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc12a4Q9JIS8 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc12a4Q9JIS8 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc12a4Q9JIS8 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc12a4Q9JIS8 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc12a4Q9JIS8 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc12a4Q9JIS8 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc12a4Q9JIS8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc12a4Q9JIS8 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc12a4Q9JIS8 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc12a4Q9JIS8 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc12a4Q9JIS8 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc12a4Q9JIS8 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc12a4Q9JIS8 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc12a4Q9JIS8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc12a4Q9JIS8 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc12a4Q9JIS8 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc12a4Q9JIS8 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc12a4Q9JIS8 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc12a4Q9JIS8 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc12a4Q9JIS8 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc12a4Q9JIS8 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc12a4Q9JIS8 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc12a4Q9JIS8 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc12a4Q9JIS8 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc12a4Q9JIS8 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc12a4Q9JIS8 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc12a4Q9JIS8 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc12a4Q9JIS8 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc12a4Q9JIS8 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc12a4Q9JIS8 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc12a4Q9JIS8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc12a4Q9JIS8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc12a4Q9JIS8 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc12a4Q9JIS8 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc12a4Q9JIS8 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc12a4Q9JIS8 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc12a4Q9JIS8 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc12a4Q9JIS8 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc12a4Q9JIS8 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc12a4Q9JIS8 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc12a4Q9JIS8 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc12a4Q9JIS8 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc12a4Q9JIS8 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc12a4Q9JIS8 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc12a4Q9JIS8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc12a4Q9JIS8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc12a4Q9JIS8 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc12a4Q9JIS8 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc12a4Q9JIS8 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc12a4Q9JIS8 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc12a4Q9JIS8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc12a4Q9JIS8 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc12a4Q9JIS8 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc12a4Q9JIS8 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc12a4Q9JIS8 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc12a4Q9JIS8 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc12a4Q9JIS8 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc12a4Q9JIS8 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms