Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG4

Ppp1r3f, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3F, mousemouse

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r3fQ9JIG4 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppp1r3fQ9JIG4 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ppp1r3fQ9JIG4 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ppp1r3fQ9JIG4 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ppp1r3fQ9JIG4 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ppp1r3fQ9JIG4 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ppp1r3fQ9JIG4 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ppp1r3fQ9JIG4 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ppp1r3fQ9JIG4 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ppp1r3fQ9JIG4 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ppp1r3fQ9JIG4 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ppp1r3fQ9JIG4 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ppp1r3fQ9JIG4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppp1r3fQ9JIG4 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppp1r3fQ9JIG4 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppp1r3fQ9JIG4 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppp1r3fQ9JIG4 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppp1r3fQ9JIG4 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppp1r3fQ9JIG4 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppp1r3fQ9JIG4 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppp1r3fQ9JIG4 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppp1r3fQ9JIG4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppp1r3fQ9JIG4 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppp1r3fQ9JIG4 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppp1r3fQ9JIG4 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppp1r3fQ9JIG4 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppp1r3fQ9JIG4 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppp1r3fQ9JIG4 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppp1r3fQ9JIG4 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppp1r3fQ9JIG4 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppp1r3fQ9JIG4 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppp1r3fQ9JIG4 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppp1r3fQ9JIG4 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppp1r3fQ9JIG4 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppp1r3fQ9JIG4 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppp1r3fQ9JIG4 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppp1r3fQ9JIG4 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppp1r3fQ9JIG4 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppp1r3fQ9JIG4 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppp1r3fQ9JIG4 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppp1r3fQ9JIG4 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppp1r3fQ9JIG4 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppp1r3fQ9JIG4 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppp1r3fQ9JIG4 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppp1r3fQ9JIG4 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppp1r3fQ9JIG4 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppp1r3fQ9JIG4 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppp1r3fQ9JIG4 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppp1r3fQ9JIG4 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppp1r3fQ9JIG4 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppp1r3fQ9JIG4 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppp1r3fQ9JIG4 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppp1r3fQ9JIG4 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppp1r3fQ9JIG4 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppp1r3fQ9JIG4 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppp1r3fQ9JIG4 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppp1r3fQ9JIG4 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppp1r3fQ9JIG4 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppp1r3fQ9JIG4 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppp1r3fQ9JIG4 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppp1r3fQ9JIG4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppp1r3fQ9JIG4 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppp1r3fQ9JIG4 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppp1r3fQ9JIG4 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ppp1r3fQ9JIG4 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ppp1r3fQ9JIG4 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ppp1r3fQ9JIG4 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppp1r3fQ9JIG4 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppp1r3fQ9JIG4 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppp1r3fQ9JIG4 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppp1r3fQ9JIG4 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppp1r3fQ9JIG4 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppp1r3fQ9JIG4 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppp1r3fQ9JIG4 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppp1r3fQ9JIG4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppp1r3fQ9JIG4 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppp1r3fQ9JIG4 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppp1r3fQ9JIG4 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppp1r3fQ9JIG4 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppp1r3fQ9JIG4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppp1r3fQ9JIG4 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppp1r3fQ9JIG4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppp1r3fQ9JIG4 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppp1r3fQ9JIG4 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppp1r3fQ9JIG4 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppp1r3fQ9JIG4 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppp1r3fQ9JIG4 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppp1r3fQ9JIG4 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppp1r3fQ9JIG4 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppp1r3fQ9JIG4 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppp1r3fQ9JIG4 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms