Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI74

Klhl1, Kelch-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl1Q9JI74 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klhl1Q9JI74 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klhl1Q9JI74 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klhl1Q9JI74 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klhl1Q9JI74 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Klhl1Q9JI74 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klhl1Q9JI74 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klhl1Q9JI74 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klhl1Q9JI74 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klhl1Q9JI74 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klhl1Q9JI74 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klhl1Q9JI74 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klhl1Q9JI74 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klhl1Q9JI74 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klhl1Q9JI74 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klhl1Q9JI74 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klhl1Q9JI74 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Klhl1Q9JI74 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Klhl1Q9JI74 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klhl1Q9JI74 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klhl1Q9JI74 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klhl1Q9JI74 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klhl1Q9JI74 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klhl1Q9JI74 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klhl1Q9JI74 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klhl1Q9JI74 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klhl1Q9JI74 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klhl1Q9JI74 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Klhl1Q9JI74 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klhl1Q9JI74 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klhl1Q9JI74 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Klhl1Q9JI74 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klhl1Q9JI74 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klhl1Q9JI74 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klhl1Q9JI74 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klhl1Q9JI74 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klhl1Q9JI74 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klhl1Q9JI74 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klhl1Q9JI74 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klhl1Q9JI74 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klhl1Q9JI74 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klhl1Q9JI74 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klhl1Q9JI74 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klhl1Q9JI74 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klhl1Q9JI74 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klhl1Q9JI74 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klhl1Q9JI74 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klhl1Q9JI74 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Klhl1Q9JI74 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klhl1Q9JI74 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klhl1Q9JI74 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klhl1Q9JI74 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klhl1Q9JI74 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klhl1Q9JI74 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klhl1Q9JI74 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klhl1Q9JI74 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klhl1Q9JI74 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klhl1Q9JI74 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klhl1Q9JI74 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klhl1Q9JI74 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klhl1Q9JI74 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klhl1Q9JI74 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klhl1Q9JI74 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klhl1Q9JI74 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klhl1Q9JI74 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klhl1Q9JI74 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klhl1Q9JI74 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klhl1Q9JI74 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Klhl1Q9JI74 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klhl1Q9JI74 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klhl1Q9JI74 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klhl1Q9JI74 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klhl1Q9JI74 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Klhl1Q9JI74 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klhl1Q9JI74 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klhl1Q9JI74 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klhl1Q9JI74 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klhl1Q9JI74 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klhl1Q9JI74 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Klhl1Q9JI74 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klhl1Q9JI74 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klhl1Q9JI74 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klhl1Q9JI74 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klhl1Q9JI74 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Klhl1Q9JI74 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klhl1Q9JI74 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klhl1Q9JI74 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klhl1Q9JI74 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klhl1Q9JI74 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl1Q9JI74 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl1Q9JI74 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl1Q9JI74 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl1Q9JI74 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl1Q9JI74 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl1Q9JI74 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl1Q9JI74 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl1Q9JI74 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl1Q9JI74 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl1Q9JI74 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl1Q9JI74 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms