Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI70

Mkks, McKusick-Kaufman/Bardet-Biedl syndromes putative chaperonin, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MkksQ9JI70 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MkksQ9JI70 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MkksQ9JI70 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MkksQ9JI70 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MkksQ9JI70 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MkksQ9JI70 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MkksQ9JI70 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MkksQ9JI70 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MkksQ9JI70 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MkksQ9JI70 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MkksQ9JI70 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MkksQ9JI70 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MkksQ9JI70 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MkksQ9JI70 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MkksQ9JI70 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MkksQ9JI70 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MkksQ9JI70 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MkksQ9JI70 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MkksQ9JI70 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MkksQ9JI70 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MkksQ9JI70 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MkksQ9JI70 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MkksQ9JI70 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MkksQ9JI70 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MkksQ9JI70 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MkksQ9JI70 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MkksQ9JI70 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MkksQ9JI70 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MkksQ9JI70 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MkksQ9JI70 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MkksQ9JI70 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MkksQ9JI70 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MkksQ9JI70 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MkksQ9JI70 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MkksQ9JI70 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MkksQ9JI70 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MkksQ9JI70 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MkksQ9JI70 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MkksQ9JI70 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MkksQ9JI70 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MkksQ9JI70 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MkksQ9JI70 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MkksQ9JI70 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MkksQ9JI70 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MkksQ9JI70 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MkksQ9JI70 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MkksQ9JI70 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MkksQ9JI70 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MkksQ9JI70 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MkksQ9JI70 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MkksQ9JI70 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MkksQ9JI70 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MkksQ9JI70 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MkksQ9JI70 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MkksQ9JI70 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
MkksQ9JI70 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MkksQ9JI70 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MkksQ9JI70 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MkksQ9JI70 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
MkksQ9JI70 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MkksQ9JI70 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
MkksQ9JI70 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MkksQ9JI70 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MkksQ9JI70 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MkksQ9JI70 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MkksQ9JI70 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MkksQ9JI70 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MkksQ9JI70 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MkksQ9JI70 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MkksQ9JI70 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MkksQ9JI70 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MkksQ9JI70 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MkksQ9JI70 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MkksQ9JI70 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MkksQ9JI70 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MkksQ9JI70 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MkksQ9JI70 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MkksQ9JI70 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MkksQ9JI70 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MkksQ9JI70 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MkksQ9JI70 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MkksQ9JI70 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MkksQ9JI70 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MkksQ9JI70 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MkksQ9JI70 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MkksQ9JI70 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MkksQ9JI70 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MkksQ9JI70 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MkksQ9JI70 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MkksQ9JI70 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MkksQ9JI70 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
MkksQ9JI70 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MkksQ9JI70 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MkksQ9JI70 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MkksQ9JI70 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MkksQ9JI70 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MkksQ9JI70 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MkksQ9JI70 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MkksQ9JI70 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MkksQ9JI70 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms