Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ0

Tmod3, Tropomodulin-3, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod3Q9JHJ0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmod3Q9JHJ0 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Tmod3Q9JHJ0 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Tmod3Q9JHJ0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmod3Q9JHJ0 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmod3Q9JHJ0 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmod3Q9JHJ0 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmod3Q9JHJ0 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmod3Q9JHJ0 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmod3Q9JHJ0 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmod3Q9JHJ0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmod3Q9JHJ0 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmod3Q9JHJ0 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmod3Q9JHJ0 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmod3Q9JHJ0 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmod3Q9JHJ0 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmod3Q9JHJ0 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmod3Q9JHJ0 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmod3Q9JHJ0 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmod3Q9JHJ0 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmod3Q9JHJ0 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmod3Q9JHJ0 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmod3Q9JHJ0 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmod3Q9JHJ0 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmod3Q9JHJ0 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmod3Q9JHJ0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmod3Q9JHJ0 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmod3Q9JHJ0 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmod3Q9JHJ0 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmod3Q9JHJ0 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmod3Q9JHJ0 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmod3Q9JHJ0 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmod3Q9JHJ0 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmod3Q9JHJ0 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmod3Q9JHJ0 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmod3Q9JHJ0 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmod3Q9JHJ0 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmod3Q9JHJ0 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmod3Q9JHJ0 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmod3Q9JHJ0 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmod3Q9JHJ0 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmod3Q9JHJ0 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmod3Q9JHJ0 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmod3Q9JHJ0 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmod3Q9JHJ0 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmod3Q9JHJ0 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmod3Q9JHJ0 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmod3Q9JHJ0 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmod3Q9JHJ0 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmod3Q9JHJ0 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmod3Q9JHJ0 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmod3Q9JHJ0 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmod3Q9JHJ0 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmod3Q9JHJ0 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmod3Q9JHJ0 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmod3Q9JHJ0 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmod3Q9JHJ0 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmod3Q9JHJ0 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmod3Q9JHJ0 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmod3Q9JHJ0 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmod3Q9JHJ0 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmod3Q9JHJ0 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmod3Q9JHJ0 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmod3Q9JHJ0 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmod3Q9JHJ0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmod3Q9JHJ0 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmod3Q9JHJ0 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmod3Q9JHJ0 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmod3Q9JHJ0 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmod3Q9JHJ0 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmod3Q9JHJ0 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmod3Q9JHJ0 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmod3Q9JHJ0 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmod3Q9JHJ0 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmod3Q9JHJ0 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmod3Q9JHJ0 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmod3Q9JHJ0 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmod3Q9JHJ0 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmod3Q9JHJ0 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmod3Q9JHJ0 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmod3Q9JHJ0 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmod3Q9JHJ0 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmod3Q9JHJ0 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmod3Q9JHJ0 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmod3Q9JHJ0 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmod3Q9JHJ0 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmod3Q9JHJ0 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmod3Q9JHJ0 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmod3Q9JHJ0 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmod3Q9JHJ0 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmod3Q9JHJ0 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmod3Q9JHJ0 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmod3Q9JHJ0 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmod3Q9JHJ0 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmod3Q9JHJ0 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmod3Q9JHJ0 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmod3Q9JHJ0 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmod3Q9JHJ0 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmod3Q9JHJ0 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmod3Q9JHJ0 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms