Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF5

Tcirg1, V-type proton ATPase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcirg1Q9JHF5 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tcirg1Q9JHF5 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tcirg1Q9JHF5 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tcirg1Q9JHF5 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tcirg1Q9JHF5 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tcirg1Q9JHF5 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tcirg1Q9JHF5 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Tcirg1Q9JHF5 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tcirg1Q9JHF5 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Tcirg1Q9JHF5 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tcirg1Q9JHF5 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tcirg1Q9JHF5 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tcirg1Q9JHF5 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tcirg1Q9JHF5 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tcirg1Q9JHF5 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tcirg1Q9JHF5 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tcirg1Q9JHF5 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tcirg1Q9JHF5 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tcirg1Q9JHF5 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tcirg1Q9JHF5 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tcirg1Q9JHF5 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tcirg1Q9JHF5 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tcirg1Q9JHF5 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Tcirg1Q9JHF5 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Tcirg1Q9JHF5 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tcirg1Q9JHF5 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tcirg1Q9JHF5 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Tcirg1Q9JHF5 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tcirg1Q9JHF5 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tcirg1Q9JHF5 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Tcirg1Q9JHF5 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tcirg1Q9JHF5 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tcirg1Q9JHF5 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Tcirg1Q9JHF5 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tcirg1Q9JHF5 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tcirg1Q9JHF5 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tcirg1Q9JHF5 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Tcirg1Q9JHF5 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Tcirg1Q9JHF5 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tcirg1Q9JHF5 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tcirg1Q9JHF5 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tcirg1Q9JHF5 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tcirg1Q9JHF5 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tcirg1Q9JHF5 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tcirg1Q9JHF5 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tcirg1Q9JHF5 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tcirg1Q9JHF5 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tcirg1Q9JHF5 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tcirg1Q9JHF5 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tcirg1Q9JHF5 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tcirg1Q9JHF5 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tcirg1Q9JHF5 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tcirg1Q9JHF5 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Tcirg1Q9JHF5 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tcirg1Q9JHF5 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tcirg1Q9JHF5 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tcirg1Q9JHF5 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tcirg1Q9JHF5 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tcirg1Q9JHF5 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tcirg1Q9JHF5 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tcirg1Q9JHF5 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tcirg1Q9JHF5 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Tcirg1Q9JHF5 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Tcirg1Q9JHF5 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tcirg1Q9JHF5 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tcirg1Q9JHF5 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tcirg1Q9JHF5 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tcirg1Q9JHF5 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Tcirg1Q9JHF5 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tcirg1Q9JHF5 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tcirg1Q9JHF5 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tcirg1Q9JHF5 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tcirg1Q9JHF5 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tcirg1Q9JHF5 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tcirg1Q9JHF5 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tcirg1Q9JHF5 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tcirg1Q9JHF5 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tcirg1Q9JHF5 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tcirg1Q9JHF5 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tcirg1Q9JHF5 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tcirg1Q9JHF5 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tcirg1Q9JHF5 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tcirg1Q9JHF5 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tcirg1Q9JHF5 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tcirg1Q9JHF5 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tcirg1Q9JHF5 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tcirg1Q9JHF5 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tcirg1Q9JHF5 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tcirg1Q9JHF5 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tcirg1Q9JHF5 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tcirg1Q9JHF5 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tcirg1Q9JHF5 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tcirg1Q9JHF5 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tcirg1Q9JHF5 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tcirg1Q9JHF5 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tcirg1Q9JHF5 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tcirg1Q9JHF5 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tcirg1Q9JHF5 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tcirg1Q9JHF5 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tcirg1Q9JHF5 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms