Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET54

Palld, Palladin, mousemouse

Predictions only

Length 1,408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PalldQ9ET54 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PalldQ9ET54 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PalldQ9ET54 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PalldQ9ET54 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PalldQ9ET54 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PalldQ9ET54 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PalldQ9ET54 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PalldQ9ET54 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PalldQ9ET54 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PalldQ9ET54 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PalldQ9ET54 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PalldQ9ET54 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PalldQ9ET54 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PalldQ9ET54 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PalldQ9ET54 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PalldQ9ET54 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PalldQ9ET54 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PalldQ9ET54 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PalldQ9ET54 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PalldQ9ET54 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PalldQ9ET54 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PalldQ9ET54 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PalldQ9ET54 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PalldQ9ET54 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PalldQ9ET54 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PalldQ9ET54 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PalldQ9ET54 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PalldQ9ET54 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PalldQ9ET54 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PalldQ9ET54 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PalldQ9ET54 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PalldQ9ET54 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PalldQ9ET54 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PalldQ9ET54 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PalldQ9ET54 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PalldQ9ET54 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PalldQ9ET54 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PalldQ9ET54 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PalldQ9ET54 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PalldQ9ET54 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PalldQ9ET54 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PalldQ9ET54 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PalldQ9ET54 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PalldQ9ET54 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PalldQ9ET54 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PalldQ9ET54 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PalldQ9ET54 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PalldQ9ET54 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PalldQ9ET54 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PalldQ9ET54 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PalldQ9ET54 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PalldQ9ET54 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PalldQ9ET54 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PalldQ9ET54 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PalldQ9ET54 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PalldQ9ET54 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PalldQ9ET54 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PalldQ9ET54 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PalldQ9ET54 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PalldQ9ET54 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PalldQ9ET54 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PalldQ9ET54 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PalldQ9ET54 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PalldQ9ET54 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PalldQ9ET54 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PalldQ9ET54 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PalldQ9ET54 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PalldQ9ET54 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PalldQ9ET54 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PalldQ9ET54 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PalldQ9ET54 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PalldQ9ET54 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PalldQ9ET54 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PalldQ9ET54 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PalldQ9ET54 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PalldQ9ET54 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PalldQ9ET54 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PalldQ9ET54 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PalldQ9ET54 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PalldQ9ET54 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PalldQ9ET54 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PalldQ9ET54 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PalldQ9ET54 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PalldQ9ET54 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PalldQ9ET54 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PalldQ9ET54 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PalldQ9ET54 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PalldQ9ET54 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PalldQ9ET54 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PalldQ9ET54 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PalldQ9ET54 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PalldQ9ET54 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PalldQ9ET54 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PalldQ9ET54 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PalldQ9ET54 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PalldQ9ET54 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PalldQ9ET54 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PalldQ9ET54 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PalldQ9ET54 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PalldQ9ET54 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms