Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Rb1cc1Q9ESK9 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Rb1cc1Q9ESK9 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Rb1cc1Q9ESK9 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Rb1cc1Q9ESK9 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
Rb1cc1Q9ESK9 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Rb1cc1Q9ESK9 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Rb1cc1Q9ESK9 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Rb1cc1Q9ESK9 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Rb1cc1Q9ESK9 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Rb1cc1Q9ESK9 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Rb1cc1Q9ESK9 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Rb1cc1Q9ESK9 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Rb1cc1Q9ESK9 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
Rb1cc1Q9ESK9 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Rb1cc1Q9ESK9 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Rb1cc1Q9ESK9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Rb1cc1Q9ESK9 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Rb1cc1Q9ESK9 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Rb1cc1Q9ESK9 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Rb1cc1Q9ESK9 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Rb1cc1Q9ESK9 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Rb1cc1Q9ESK9 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Rb1cc1Q9ESK9 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Rb1cc1Q9ESK9 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Rb1cc1Q9ESK9 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Rb1cc1Q9ESK9 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Rb1cc1Q9ESK9 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Rb1cc1Q9ESK9 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Rb1cc1Q9ESK9 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Rb1cc1Q9ESK9 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Rb1cc1Q9ESK9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Rb1cc1Q9ESK9 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Rb1cc1Q9ESK9 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Rb1cc1Q9ESK9 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Rb1cc1Q9ESK9 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
Rb1cc1Q9ESK9 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Rb1cc1Q9ESK9 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Rb1cc1Q9ESK9 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Rb1cc1Q9ESK9 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Rb1cc1Q9ESK9 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Rb1cc1Q9ESK9 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Rb1cc1Q9ESK9 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Rb1cc1Q9ESK9 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Rb1cc1Q9ESK9 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Rb1cc1Q9ESK9 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Rb1cc1Q9ESK9 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Rb1cc1Q9ESK9 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Rb1cc1Q9ESK9 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Rb1cc1Q9ESK9 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Rb1cc1Q9ESK9 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Rb1cc1Q9ESK9 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Rb1cc1Q9ESK9 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Rb1cc1Q9ESK9 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Rb1cc1Q9ESK9 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Rb1cc1Q9ESK9 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Rb1cc1Q9ESK9 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
Rb1cc1Q9ESK9 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Rb1cc1Q9ESK9 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Rb1cc1Q9ESK9 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Rb1cc1Q9ESK9 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Rb1cc1Q9ESK9 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Rb1cc1Q9ESK9 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
Rb1cc1Q9ESK9 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Rb1cc1Q9ESK9 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Rb1cc1Q9ESK9 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Rb1cc1Q9ESK9 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Rb1cc1Q9ESK9 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Rb1cc1Q9ESK9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Rb1cc1Q9ESK9 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Rb1cc1Q9ESK9 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Rb1cc1Q9ESK9 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Rb1cc1Q9ESK9 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Rb1cc1Q9ESK9 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Rb1cc1Q9ESK9 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
Rb1cc1Q9ESK9 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Rb1cc1Q9ESK9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Rb1cc1Q9ESK9 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Rb1cc1Q9ESK9 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Rb1cc1Q9ESK9 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Rb1cc1Q9ESK9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Rb1cc1Q9ESK9 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Rb1cc1Q9ESK9 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Rb1cc1Q9ESK9 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Rb1cc1Q9ESK9 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Rb1cc1Q9ESK9 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Rb1cc1Q9ESK9 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Rb1cc1Q9ESK9 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC32.2■■■□□ 2.74
Rb1cc1Q9ESK9 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Rb1cc1Q9ESK9 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Rb1cc1Q9ESK9 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Rb1cc1Q9ESK9 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms