Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Usp29Q9ES63 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp29Q9ES63 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp29Q9ES63 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp29Q9ES63 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp29Q9ES63 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp29Q9ES63 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp29Q9ES63 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Usp29Q9ES63 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp29Q9ES63 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Usp29Q9ES63 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp29Q9ES63 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Usp29Q9ES63 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp29Q9ES63 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp29Q9ES63 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19■□□□□ 0.63
Usp29Q9ES63 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp29Q9ES63 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Usp29Q9ES63 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp29Q9ES63 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp29Q9ES63 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp29Q9ES63 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp29Q9ES63 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp29Q9ES63 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp29Q9ES63 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp29Q9ES63 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp29Q9ES63 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp29Q9ES63 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp29Q9ES63 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp29Q9ES63 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp29Q9ES63 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp29Q9ES63 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
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Usp29Q9ES63 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp29Q9ES63 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp29Q9ES63 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp29Q9ES63 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp29Q9ES63 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp29Q9ES63 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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Usp29Q9ES63 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp29Q9ES63 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp29Q9ES63 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp29Q9ES63 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp29Q9ES63 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp29Q9ES63 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp29Q9ES63 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp29Q9ES63 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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Usp29Q9ES63 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp29Q9ES63 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp29Q9ES63 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp29Q9ES63 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp29Q9ES63 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp29Q9ES63 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp29Q9ES63 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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Usp29Q9ES63 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp29Q9ES63 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp29Q9ES63 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp29Q9ES63 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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Usp29Q9ES63 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp29Q9ES63 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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Usp29Q9ES63 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp29Q9ES63 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp29Q9ES63 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp29Q9ES63 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp29Q9ES63 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp29Q9ES63 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp29Q9ES63 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp29Q9ES63 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp29Q9ES63 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp29Q9ES63 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp29Q9ES63 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp29Q9ES63 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp29Q9ES63 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp29Q9ES63 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp29Q9ES63 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp29Q9ES63 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp29Q9ES63 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp29Q9ES63 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp29Q9ES63 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp29Q9ES63 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp29Q9ES63 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp29Q9ES63 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp29Q9ES63 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp29Q9ES63 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp29Q9ES63 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp29Q9ES63 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp29Q9ES63 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp29Q9ES63 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp29Q9ES63 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp29Q9ES63 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp29Q9ES63 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms