Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES56

Trappc4, Trafficking protein particle complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc4Q9ES56 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc4Q9ES56 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc4Q9ES56 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc4Q9ES56 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc4Q9ES56 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc4Q9ES56 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc4Q9ES56 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc4Q9ES56 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc4Q9ES56 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc4Q9ES56 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc4Q9ES56 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc4Q9ES56 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc4Q9ES56 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc4Q9ES56 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc4Q9ES56 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc4Q9ES56 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc4Q9ES56 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc4Q9ES56 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc4Q9ES56 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc4Q9ES56 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc4Q9ES56 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc4Q9ES56 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc4Q9ES56 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc4Q9ES56 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc4Q9ES56 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc4Q9ES56 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc4Q9ES56 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc4Q9ES56 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc4Q9ES56 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc4Q9ES56 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc4Q9ES56 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc4Q9ES56 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc4Q9ES56 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc4Q9ES56 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc4Q9ES56 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc4Q9ES56 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc4Q9ES56 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc4Q9ES56 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc4Q9ES56 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc4Q9ES56 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc4Q9ES56 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc4Q9ES56 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc4Q9ES56 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc4Q9ES56 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc4Q9ES56 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc4Q9ES56 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc4Q9ES56 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc4Q9ES56 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc4Q9ES56 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc4Q9ES56 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc4Q9ES56 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc4Q9ES56 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc4Q9ES56 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc4Q9ES56 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc4Q9ES56 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc4Q9ES56 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc4Q9ES56 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc4Q9ES56 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc4Q9ES56 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc4Q9ES56 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc4Q9ES56 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc4Q9ES56 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc4Q9ES56 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc4Q9ES56 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc4Q9ES56 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc4Q9ES56 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc4Q9ES56 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc4Q9ES56 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc4Q9ES56 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc4Q9ES56 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc4Q9ES56 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc4Q9ES56 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc4Q9ES56 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc4Q9ES56 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc4Q9ES56 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc4Q9ES56 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc4Q9ES56 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc4Q9ES56 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc4Q9ES56 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc4Q9ES56 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc4Q9ES56 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc4Q9ES56 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc4Q9ES56 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc4Q9ES56 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc4Q9ES56 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc4Q9ES56 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc4Q9ES56 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc4Q9ES56 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc4Q9ES56 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc4Q9ES56 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc4Q9ES56 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc4Q9ES56 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc4Q9ES56 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc4Q9ES56 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc4Q9ES56 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc4Q9ES56 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc4Q9ES56 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc4Q9ES56 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc4Q9ES56 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc4Q9ES56 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms