Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB0

Snap29, Synaptosomal-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap29Q9ERB0 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snap29Q9ERB0 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snap29Q9ERB0 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snap29Q9ERB0 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snap29Q9ERB0 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snap29Q9ERB0 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snap29Q9ERB0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snap29Q9ERB0 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snap29Q9ERB0 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snap29Q9ERB0 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snap29Q9ERB0 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snap29Q9ERB0 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snap29Q9ERB0 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snap29Q9ERB0 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snap29Q9ERB0 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snap29Q9ERB0 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snap29Q9ERB0 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Snap29Q9ERB0 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snap29Q9ERB0 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Snap29Q9ERB0 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snap29Q9ERB0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snap29Q9ERB0 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Snap29Q9ERB0 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Snap29Q9ERB0 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snap29Q9ERB0 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snap29Q9ERB0 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snap29Q9ERB0 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snap29Q9ERB0 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snap29Q9ERB0 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snap29Q9ERB0 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snap29Q9ERB0 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snap29Q9ERB0 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snap29Q9ERB0 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snap29Q9ERB0 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snap29Q9ERB0 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snap29Q9ERB0 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snap29Q9ERB0 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snap29Q9ERB0 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snap29Q9ERB0 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snap29Q9ERB0 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snap29Q9ERB0 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snap29Q9ERB0 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snap29Q9ERB0 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snap29Q9ERB0 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snap29Q9ERB0 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snap29Q9ERB0 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snap29Q9ERB0 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snap29Q9ERB0 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snap29Q9ERB0 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snap29Q9ERB0 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snap29Q9ERB0 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snap29Q9ERB0 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Snap29Q9ERB0 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snap29Q9ERB0 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snap29Q9ERB0 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snap29Q9ERB0 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snap29Q9ERB0 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snap29Q9ERB0 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snap29Q9ERB0 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snap29Q9ERB0 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snap29Q9ERB0 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snap29Q9ERB0 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snap29Q9ERB0 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snap29Q9ERB0 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snap29Q9ERB0 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snap29Q9ERB0 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snap29Q9ERB0 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snap29Q9ERB0 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snap29Q9ERB0 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snap29Q9ERB0 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snap29Q9ERB0 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snap29Q9ERB0 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Snap29Q9ERB0 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Snap29Q9ERB0 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Snap29Q9ERB0 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snap29Q9ERB0 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snap29Q9ERB0 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snap29Q9ERB0 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snap29Q9ERB0 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snap29Q9ERB0 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snap29Q9ERB0 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snap29Q9ERB0 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snap29Q9ERB0 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snap29Q9ERB0 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snap29Q9ERB0 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snap29Q9ERB0 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snap29Q9ERB0 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snap29Q9ERB0 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snap29Q9ERB0 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snap29Q9ERB0 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snap29Q9ERB0 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snap29Q9ERB0 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snap29Q9ERB0 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snap29Q9ERB0 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Snap29Q9ERB0 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snap29Q9ERB0 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snap29Q9ERB0 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Snap29Q9ERB0 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snap29Q9ERB0 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snap29Q9ERB0 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms