Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA6

Tfip11, Tuftelin-interacting protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfip11Q9ERA6 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tfip11Q9ERA6 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tfip11Q9ERA6 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tfip11Q9ERA6 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tfip11Q9ERA6 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Tfip11Q9ERA6 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tfip11Q9ERA6 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tfip11Q9ERA6 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tfip11Q9ERA6 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tfip11Q9ERA6 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tfip11Q9ERA6 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Tfip11Q9ERA6 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tfip11Q9ERA6 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tfip11Q9ERA6 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tfip11Q9ERA6 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tfip11Q9ERA6 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tfip11Q9ERA6 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tfip11Q9ERA6 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tfip11Q9ERA6 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tfip11Q9ERA6 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tfip11Q9ERA6 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tfip11Q9ERA6 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tfip11Q9ERA6 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tfip11Q9ERA6 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tfip11Q9ERA6 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tfip11Q9ERA6 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tfip11Q9ERA6 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tfip11Q9ERA6 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tfip11Q9ERA6 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tfip11Q9ERA6 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tfip11Q9ERA6 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tfip11Q9ERA6 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tfip11Q9ERA6 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tfip11Q9ERA6 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tfip11Q9ERA6 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tfip11Q9ERA6 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tfip11Q9ERA6 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tfip11Q9ERA6 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tfip11Q9ERA6 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Tfip11Q9ERA6 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tfip11Q9ERA6 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tfip11Q9ERA6 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tfip11Q9ERA6 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tfip11Q9ERA6 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tfip11Q9ERA6 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Tfip11Q9ERA6 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tfip11Q9ERA6 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tfip11Q9ERA6 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tfip11Q9ERA6 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Tfip11Q9ERA6 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tfip11Q9ERA6 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tfip11Q9ERA6 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tfip11Q9ERA6 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Tfip11Q9ERA6 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tfip11Q9ERA6 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tfip11Q9ERA6 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tfip11Q9ERA6 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tfip11Q9ERA6 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tfip11Q9ERA6 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tfip11Q9ERA6 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tfip11Q9ERA6 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
Tfip11Q9ERA6 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Tfip11Q9ERA6 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tfip11Q9ERA6 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tfip11Q9ERA6 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tfip11Q9ERA6 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tfip11Q9ERA6 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tfip11Q9ERA6 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tfip11Q9ERA6 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tfip11Q9ERA6 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tfip11Q9ERA6 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tfip11Q9ERA6 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tfip11Q9ERA6 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tfip11Q9ERA6 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tfip11Q9ERA6 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tfip11Q9ERA6 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tfip11Q9ERA6 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tfip11Q9ERA6 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tfip11Q9ERA6 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tfip11Q9ERA6 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tfip11Q9ERA6 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tfip11Q9ERA6 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tfip11Q9ERA6 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tfip11Q9ERA6 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tfip11Q9ERA6 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tfip11Q9ERA6 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tfip11Q9ERA6 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tfip11Q9ERA6 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tfip11Q9ERA6 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tfip11Q9ERA6 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Tfip11Q9ERA6 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tfip11Q9ERA6 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tfip11Q9ERA6 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tfip11Q9ERA6 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tfip11Q9ERA6 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tfip11Q9ERA6 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tfip11Q9ERA6 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tfip11Q9ERA6 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tfip11Q9ERA6 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Tfip11Q9ERA6 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms